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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 药物与高分子材料之间的相互作用方式能用软件模拟出来吗？
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niwopengyou

木虫 (正式写手)

[求助] 药物与高分子材料之间的相互作用方式能用软件模拟出来吗？

大家好，请问药物分子与高分子材料之间的作用方式及其结构能用软件模拟出来吗？用哪种软件可以模拟，需要知道些什么参数？谢谢！
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1楼 2013-07-17 14:05:35
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huyingdamon

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-07-18 16:23:19
可以的，用gromacs，amber都可以的，他们可以计算出相互作用能，首先你要得到你模拟东西的top文件
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2楼2013-07-17 14:35:31
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niwopengyou

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huyingdamon at 2013-07-17 14:35:31
可以的，用gromacs，amber都可以的，他们可以计算出相互作用能，首先你要得到你模拟东西的top文件

非常感谢您给我回复，我对这方面一点都不懂，什么是top文件？我的药物是个小分子，和两种材料先后作用，一种是大分子的，另一种是高分子聚合物，通过红外，x衍射，DSC分析，三者之间是通过氢键作用。但是不清楚这个高分子材料和前两者是怎么结合的，想通过模拟来知道他们结合后的结构。三者的结构式都是有的，不知道还需要什么信息？谢谢！
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3楼2013-07-17 14:46:12
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dubo

金虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-07-18 16:23:31
整个体系粒子数多么？如果不多的话，建议用高斯或DFT做
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4楼2013-07-17 19:55:03
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