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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..
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hy5186681

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
641424楼: Originally posted by hyff at 2011-05-06 14:50:26
初始盒子是用‘dimensions’的方法建立的，hmatrix矩阵的值是通过密度和分子数算出来的……...

楼主你好：

想问一下气液盒子的hmatrix矩阵的值分别是怎么算的？  

你说是通过密度和分子数算出来的；密度是什么条件下的密度？

PS：NVT系踪 。
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11楼2012-08-30 10:54:56
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992648352

银虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 043114076 at 2011-05-06 15:24:06
建议首先运行MC或者MD分别得到平衡的气相和液相,然后再进行GEMC.
如果要得到液相的平衡态的话最好使用MD,我用过towhee跑平衡态,实在是太慢了

你好，请问下先运行MC或者MD得到平衡的气液相的意思是？举个例子，要模拟苯的温度 T 下的汽液平衡态，先采用NVT（还是NPT）跑一个盒子（假设是气相）得到平衡结果，再跑另一个盒子（接下来是液相）得到平衡结果。再怎样进行GEMC？把两个平衡结果作为初始文件？？还是根据他们的平衡值去设定进行GEMC时的input里面的参数。
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12楼2014-06-22 01:44:21
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 992648352 at 2014-06-22 01:44:21
你好，请问下先运行MC或者MD得到平衡的气液相的意思是？举个例子，要模拟苯的温度 T 下的汽液平衡态，先采用NVT（还是NPT）跑一个盒子（假设是气相）得到平衡结果，再跑另一个盒子（接下来是液相）得到平衡结果。再 ...

把平衡结果作为初始结构去做MC。
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992648352
13楼2014-06-23 11:22:18
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992648352

银虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 043114076 at 2014-06-23 11:22:18
把平衡结果作为初始结构去做MC。...

恩，今天想尝试一下。单个盒子用NPT还是NVT啊？应该是先NVT跑出汽液平衡相吧？谢谢。刚接触towhee，希望师兄指点下！！！万分感谢
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14楼2014-06-23 20:18:17
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 992648352 at 2014-06-23 20:18:17
恩，今天想尝试一下。单个盒子用NPT还是NVT啊？应该是先NVT跑出汽液平衡相吧？谢谢。刚接触towhee，希望师兄指点下！！！万分感谢...

是的，NVT
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15楼2014-06-23 20:48:01
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992648352

银虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by 043114076 at 2014-06-23 11:22:18
把平衡结果作为初始结构去做MC。...

得到两个（一个气相，一个液相）平衡构型，怎样同时使用它们啊？？
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16楼2014-06-24 16:59:05
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