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hyff

铁虫 (初入文坛)

[求助] 使用towhee进行GEMC模拟相平衡的MC运动定义问题..

towhee新手,想使用GEMC方法来模拟二元相平衡。
目前已经建立了两个盒子来模拟气液两相,BOX1初始为气相分子200个,BOX2初始为液相分子200个。

MC运动函数部分是从example里的Amber_IsoPropanol这个基础上尝试改为二元体系的,根据说明将相关的pm2cbswmt,pmcbmt等都赋了两个值,但试算之后发现只有BOX1中的气相分子可以插入BOX2,BOX2中的液相分子无法插入BOX1,结果也就无法达到化学势平衡。

求教使用过towhee进行过GEMC模拟和相平衡模拟的高手指点交流..
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043114076

木虫 (正式写手)

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hyff(金币+2): 感谢回应~ 2011-05-05 14:29:04
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-05-05 21:29:24
我也尝试过气液平衡模拟,确实比较难
你的pm2cbswmt,pmcbmt 如何赋值的贴出来看看,
4楼2011-05-05 13:22:11
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
hyff(金币+5): 感谢回应~ 2011-05-06 14:45:47
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-06 19:32:04
不太清楚你使用的是什么分子,我的理解是这样的:由于分子之间结合能比较大使得从液相拿出一个分子相当不容易,所以你可以尝试加大从box2到box1的概率.另外,你的两个初始盒子是怎么得到的?是否合理?
6楼2011-05-06 13:58:56
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
hyff(金币+8): 谢谢~ 2011-05-06 15:53:17
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-06 19:32:13
建议首先运行MC或者MD分别得到平衡的气相和液相,然后再进行GEMC.
如果要得到液相的平衡态的话最好使用MD,我用过towhee跑平衡态,实在是太慢了
8楼2011-05-06 15:24:06
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043114076

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 992648352 at 2014-06-22 01:44:21
你好,请问下先运行MC或者MD得到平衡的气液相的意思是?举个例子,要模拟苯的温度 T 下的汽液平衡态,先采用NVT(还是NPT)跑一个盒子(假设是气相)得到平衡结果,再跑另一个盒子(接下来是液相)得到平衡结果。再 ...

把平衡结果作为初始结构去做MC。

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13楼2014-06-23 11:22:18
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043114076

木虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 992648352 at 2014-06-23 20:18:17
恩,今天想尝试一下。单个盒子用NPT还是NVT啊?应该是先NVT跑出汽液平衡相吧?谢谢。刚接触towhee,希望师兄指点下!!!万分感谢...

是的,NVT
15楼2014-06-23 20:48:01
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