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sdjnyxn123

银虫 (小有名气)

[求助] 请问为什么测序对了的重组质粒,双酶能切出其他条带 已有4人参与

做表达做了快一年了一直没有表达出来,心里快急死了···

是一个pet30与目的基因的重组质粒,目的基因117bp,总共只有11kDa大小的氨基酸,尝试了多次诱导表达都不成功

测序没有问题(只测了T7启动子后的序列,加上插入的目的基因序列,跟给出的pet30序列图是完全相同的,翻译成氨基酸理论上也可以正常表达)

目前在找问题,发现酶切这个地方一直有问题没有解决

请问为什么测序对了的重组质粒,双酶能切出其他条带
这个是提取的质粒的照片
之后将此质粒转化入其他BL21和DH5a,测序也都正确;

请问为什么测序对了的重组质粒,双酶能切出其他条带-1
这个是将此质粒进行双酶切的电泳照片
请问为什么在1000多和3000多的地方也有条带呢?
按理说商业质粒不应该会有其他部位能切开的吧?请问这是什么原因呢?
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liuxinyueer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1.商业质粒查看质粒图谱、序列,EcoRI和XhoI切后明显有多条条带。
2.异源表达建议用偏好密码子
3.查看T7启动子是否在目的细胞中属于强启动子
欢迎讨论,小木虫未能及时回复,请邮箱: lmzhang1994@gmail.com
2楼2015-12-26 20:32:25
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科学小覃

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
从提取的质粒看质量不是很好,存在很多开环或线性质粒,试想一下线性质粒被单酶切有没有出现上述情况呢?
生物科学
3楼2015-12-26 20:47:55
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siriusxuan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你知道星号活性么,消化了多久?用的哪家的酶。
此座可言轻社稷,江山万里起风尘。
4楼2015-12-27 11:36:40
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yoxue

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
质粒双酶切的目的片段太小,因此质量就低,在电泳后带浅或看不清(或看不到)是很正常的

发自小木虫Android客户端
5楼2015-12-27 13:31:34
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sdjnyxn123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by siriusxuan at 2015-12-27 11:36:40
你知道星号活性么,消化了多久?用的哪家的酶。

是takara的,消化了6小时左右

星号活性了解过,但是不太清楚是哪里不对,按理说试剂盒里应该不会有乱七八糟的东西吧···我去借其他实验室的做一下看看
6楼2015-12-27 17:38:09
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siriusxuan

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by sdjnyxn123 at 2015-12-27 17:38:09
是takara的,消化了6小时左右

星号活性了解过,但是不太清楚是哪里不对,按理说试剂盒里应该不会有乱七八糟的东西吧···我去借其他实验室的做一下看看...

6个小时有点太久了,但如果是takera快酶系列的应该没什么问题,可以半个小时尝试一下啊。
此座可言轻社稷,江山万里起风尘。
7楼2015-12-27 20:30:19
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wanglixin90

新虫 (初入文坛)

有可能是酶用的时间太长了,可以换个新鲜的酶试试。我之前也遇到过类似的问题,换了新酶之后就好了

发自小木虫Android客户端
8楼2015-12-27 23:09:16
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lyc910217

金虫 (初入文坛)

我前面也出现过这种情况,有可能像前面几位虫友说的一样,你的质粒在提取过程中存在问题,而你在双酶切时,酶的活性不好,所以出现这样的问题,你可以重提一次质粒,重新买两管酶试试,现在已经有快速酶切的酶了,可以试试

发自小木虫IOS客户端
菜鸟,兽医
9楼2015-12-28 08:42:38
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zht930528

木虫 (正式写手)

麻辣王子

同样的 ,我前两周做的双酶切可以切出来两条带,但之后双酶切却切出来三条带(包含两条目的带,额外一条2000bp大小的带,同样的体系。也不知道什么原因,测序显示结果正确 ,也就没有过多去考虑这个现象。 先留名 看看还有没有更好的答案。
麻辣王子不爱做实验
10楼2015-12-28 11:14:53
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