| 查看: 2330 | 回复: 6 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
wyangdao木虫 (正式写手)
|
[求助]
用gromacs软件做逐渐升温的时候出现这个问题，求如何解决 已有1人参与
|
|
|
这是我的md.mdp文件的一部分。 Tcoupl = berendsen tau_t = 0.1 0.1 tc_grps = 14A sol ref_t = 300 300 annealing = single annealing_npoints = 4 annealing_time = 0 5 10 30 annealing_temp = 293 373 373 277 错误提示是： Program grompp_mpi, VERSION 4.0.4 Source code file: readir.c, line: 1508 Fatal error: Not enough annealing values: 1 (for 2 groups) |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs中的mdp文件的编译问题
已经有6人回复
- 关于MS和GROMACS文件转换的问题
已经有8人回复
- gromacs氢键分析工具，g_hbond输出结果解析？
已经有11人回复
- 如何将amber的轨迹文件mdcrd格式转换成gromacs的轨迹文件格式 trr呢
已经有5人回复
- 请教gromacs蛋白与小分子相互作用分析
已经有12人回复
- autodock与gromacs在Windows下的安装
已经有10人回复
- gromacs 模拟时如何固定金属离子的问题
已经有10人回复
- gromacs 模拟出现周期性问题
已经有6人回复
- 怎么用gromacs模拟混合溶剂？跪求大牛指导。。。
已经有15人回复
- gromacs编译安装
已经有11人回复
- Gromacs粗粒化力场（自己写）
已经有11人回复
- 离子液体模拟：如何从别的软件移植力场到Gromacs（itp文件的含义以及如何写itp文件）
已经有4人回复
- gromacs自己添加residue遇到的问题
已经有6人回复
- gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
已经有7人回复
- 如何用MS的纳米管坐标转到gromacs可识别的文件
已经有7人回复
- 求Gromacs中文手册
已经有4人回复
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- [新手求教]安装Gromacs后，查看pdb2gmx命令，显示无此命令
已经有9人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】重金求助：gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件
已经有8人回复
- 【原创】在gromacs的gro中插入小分子
已经有12人回复
- 【求助】求一个gromacs的中文教程，包括安装的部分，小弟新手，从零学起
已经有8人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
7楼2018-05-30 11:15:31
franksha
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1473.1
- 散金: 500
- 红花: 1
- 帖子: 486
- 在线: 384.8小时
- 虫号: 494131
- 注册: 2008-01-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
2楼2015-07-03 15:26:34
wyangdao
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2661.5
- 散金: 188
- 红花: 4
- 帖子: 305
- 在线: 275小时
- 虫号: 2715312
- 注册: 2013-10-11
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
|
; Temperature coupling is on tcoupl = Berendsen ; modified Berendsen thermostat tc-grps = Protein Non-Protein ; two coupling groups - more accurate tau_t = 0.1 0.1 ; time constant, in ps ref_t = 300 300 ; reference temperature, one for each group, in K annealing = single single annealing‐npoints = 4 4 annealing‐time = 0 10 20 55 0 10 20 55 annealing‐temp = 300 313 323 293 300 313 323 293 出现这样的错误 Fatal error: Found 0 annealing-npoints values for 2 groups |
3楼2015-07-03 20:08:44
wyangdao
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 2661.5
- 散金: 188
- 红花: 4
- 帖子: 305
- 在线: 275小时
- 虫号: 2715312
- 注册: 2013-10-11
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
4楼2015-07-03 20:10:21
10