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id90

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助TCA沉淀浓度蛋白的问题 已有2人参与

我做的是毕赤酵母表达外源蛋白,由于蛋白的表达量较少,需要浓缩后,电泳分析。
我用的TCA方法是:  1mL 样品中加入180μL ~ 200μL 预冷的TCA,充分震荡,于4℃保存过夜。第二天离心去掉上清,加入200μL预冷的丙酮,洗涤两次。沉淀用缓冲液重溶,电泳。
我的问题是:样品是通过离子交换柱浓缩得到的、具有活性,但是加入TCA后没有沉淀出现,所以离心去上清的时候我保留几μL的液体,再加入丙酮,就会有白色沉淀出现。之后进行电泳,能看到目的蛋白。是不是TCA不能沉淀出蛋白,而丙酮将蛋白沉淀出来,也有人说丙酮沉淀出的是盐。求助我的方法是不是有问题,需要怎么改进?
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匿名

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2楼2015-03-10 13:33:26
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帖航

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
id90: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-03-12 09:26:06
首先了解一下TCA沉淀的原理,TCA是酸,可以使蛋白变性,从而沉淀下来,另外TCA可以与蛋白形成不溶性的盐。总之TCA沉淀一般是不可逆的,也就是TCA是用来除杂蛋白的,而且效果是很明显的,你的样品加入TCA后没有沉淀是你的TCA浓度不够,你加大TCA浓度肯定有沉淀,可以做一个TCA梯度试试。
但是,个人建议,像我上述所说,TCA沉淀一般不可逆,所以建议你TAC沉淀过程尽量使你的目的蛋白保留在上清液中,然后用丙酮再纯化一次。
丙酮属于有机溶剂沉淀蛋白,是剥离蛋白的水化膜,从而使蛋白分子碰撞沉淀,稀释后可以复性。你所说的丙酮沉淀生成盐是错误的,酸还有重金属沉淀蛋白才会生成盐。
3楼2015-03-10 14:25:42
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id90

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 立林258369 at 2015-03-10 13:33:26
我曾经试过这种沉淀方法,效果一般,你的可能是初始蛋白浓度太低,冷冻干燥机干燥效果好一些,浓缩的不错,可以试一下

谢谢回复,冻干可以尝试下 。冻干后的盐会不会对电泳产生影响。
4楼2015-03-10 16:36:06
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id90

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 帖航 at 2015-03-10 14:25:42
首先了解一下TCA沉淀的原理,TCA是酸,可以使蛋白变性,从而沉淀下来,另外TCA可以与蛋白形成不溶性的盐。总之TCA沉淀一般是不可逆的,也就是TCA是用来除杂蛋白的,而且效果是很明显的,你的样品加入TCA后没有沉淀是 ...

谢谢回复,我用发酵液做TCA能看到有沉淀,离子交换浓缩没有。可能是我的目的蛋白含量太少,我准备做一个梯度试一试。如果使用丙酮纯化需要的浓度是多少?80%?
5楼2015-03-10 16:49:38
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帖航

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by id90 at 2015-03-10 16:49:38
谢谢回复,我用发酵液做TCA能看到有沉淀,离子交换浓缩没有。可能是我的目的蛋白含量太少,我准备做一个梯度试一试。如果使用丙酮纯化需要的浓度是多少?80%?...

具体多少浓度都是做预实验或者查文献的,不同的蛋白有不同的浓度,我以前做纯化时,用过50%也用过75%。这就考察本科时的实验功底了。还有离子交换浓缩我只听说过,具体的没见过,根据我多年的纯化经验,离子交换浓缩很难实现,过柱后不稀释已经很难得了,别说浓缩了。你可以问问GE分离纯化的技术部,他们肯定也不建议使用离子交换浓缩。至于TCA和丙酮他们其实是起到一个生物富集作用,纯化还是要过柱子的。纯化后再浓缩就不能在引入其他成分了(置换缓冲液除外),这是要考虑用PEG或者超滤管浓缩,有钱的就用分子筛干胶,转固体用冻干,真空干燥也可以考虑。喷雾干燥不适合。
6楼2015-03-10 20:09:25
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帖航

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 帖航 at 2015-03-10 20:09:25
具体多少浓度都是做预实验或者查文献的,不同的蛋白有不同的浓度,我以前做纯化时,用过50%也用过75%。这就考察本科时的实验功底了。还有离子交换浓缩我只听说过,具体的没见过,根据我多年的纯化经验,离子交换浓 ...

我又看了一眼你的问题,你是先过柱子再用TCA沉淀?哪有这么干的!
7楼2015-03-10 20:19:51
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id90

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 帖航 at 2015-03-10 20:19:51
我又看了一眼你的问题,你是先过柱子再用TCA沉淀?哪有这么干的!...

看来我没有表达清楚,我用离子交换柱纯化,得到的样品直接电泳看不到条带,我用TCA是为了浓缩再跑电泳。TCA后是为了跑电泳,不是为了后期纯化。
8楼2015-03-11 00:02:02
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Pangtai

新虫 (初入文坛)

内容已删除
9楼2015-10-29 19:59:35
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gao19890724

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by Pangtai at 2015-10-29 19:59:35
想问楼主问题解决了吗?最近我也在用TCA浓缩蛋白,用于SDS-PAGE。用的16%终浓度的TCA,加入后有沉淀产生,用丙酮洗两次后,加入缓冲液并不能重溶这些沉淀,不知道诸位是否遇到过这个问题;因此后续电泳跑出了成团的拖 ...

你的问题解决了吗?
10楼2015-11-17 16:43:17
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