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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 请教引物设计问题！！
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guyue900905

新虫 (初入文坛)

[求助] 请教引物设计问题！！ 已有2人参与

我想找乳酸菌属的LuxS基因在NCBI上的全基因序列，我能找到Luxs基因，但是搜索完出来好多条，我没办法知道哪个是我要的，求大神指点，非常感谢！
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1楼 2015-01-28 09:12:31
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
把那几条链都复制下来，进行同源性比对，几条链里同源性最好的那条，应给就是你要的里。
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采菊东篱下，悠然见南山。
2楼2015-01-28 09:32:36
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guyue900905

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 781055707 at 2015-01-28 09:32:36
把那几条链都复制下来，进行同源性比对，几条链里同源性最好的那条，应给就是你要的里。

我现在不知道他的序列，想找它的序列，一搜出来很多，不知道哪个是我要的
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3楼2015-01-28 10:16:24
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by guyue900905 at 2015-01-28 10:16:24
我现在不知道他的序列，想找它的序列，一搜出来很多，不知道哪个是我要的...

你先多序列比对，找到能设计出引物的地方，在你有的乳酸菌里扩增一段，测序，在比对一下，你就知道那一条是你要的了
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4楼2015-01-28 10:51:14
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781055707

木虫 (著名写手)
ATGGCTAAAGTTGAAAGTTTTACATTAGATCACACAAAGGTTAAGGCACCTTACGTTCGTTTAATTACCG
TTGAAGAAGGGGCAAAGGGAGATAAAATTAGCAACTATGATTTACGGTTAGTCCAACCAAATGAAAATGC
AATTCCAACTGCTGGTTTACATACGATTGAACACTTACTTGCTGGCTTGCTTCGTGACCGTTTGGATGGC
GTGATTGATTGTTCCCCATTTGGCTGCCGGACTGGTTTCCACTTAATTACGTGGGGTGAACACTCAACTA
CTGAAGTTGCCAAGGCCTTGAAGTCCTCACTTGAAGAAATTGCCTACAAGACTAAGTGGGAAGATGTTCA
GGGAACAACGATTGAATCTTGCGGTAACTACCGTGATCATTCATTATTCTCTGCTAAGGAATGGTCAAAG
AAGATTCTTGATGAAGGGATTTCAGATAAGCCATTTGAACGCCACGTGGTTGACTAA这段同源性好些。文件里都是你要的，以ATG开头，
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  • 附件 1 : LuxS基因.rar
    • 2015-01-28 11:20:54, 4.13 K
采菊东篱下，悠然见南山。
5楼2015-01-28 11:20:29
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