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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教shRNA设计问题
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gundamba

木虫 (小有名气)

[求助] 请教shRNA设计问题

本人要设计shRNA，网上查目的序列应该为21bp，但是文献里给的序列一般只有19bp，请问有没有必要一定要设计到21bp呢？如果需要，是在后边补两个互补碱基还是随便加上两个AA或者TT呢？
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1楼 2013-04-03 12:01:00
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 鼓励应助，分子生物版块，期待你的精彩。 2013-04-06 12:42:31
gundamba: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-04-07 16:53:28
两者都是可以的，不知道你是哪个物种，如果是mouse,rat,human的话，可到TRC里面去找预设的shRNA
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-04-03 19:32:46
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gundamba: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-04-07 16:53:35
gundamba: 金币+10 2013-08-01 15:12:08
我一般在后面补两个互补碱基
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3楼2013-04-05 22:30:44
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gundamba

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-03 19:32:46
两者都是可以的，不知道你是哪个物种，如果是mouse,rat,human的话，可到TRC里面去找预设的shRNA

多谢您，请问这个TRC是去哪里找呢？
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4楼2013-04-07 16:52:11
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kikie

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

http://www.broadinstitute.org/rnai/trc/lib
其实google一下就有了
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性痴则志凝，故书痴者文必工，艺痴者技必良；世之落拓无成者，皆自谓不痴者也
5楼2013-04-08 02:24:32
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