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gundamba

木虫 (小有名气)

[求助] 请教shRNA设计问题

本人要设计shRNA,网上查目的序列应该为21bp,但是文献里给的序列一般只有19bp,请问有没有必要一定要设计到21bp呢?如果需要,是在后边补两个互补碱基还是随便加上两个AA或者TT呢?
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 鼓励应助,分子生物版块,期待你的精彩。 2013-04-06 12:42:31
gundamba: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-04-07 16:53:28
两者都是可以的,不知道你是哪个物种,如果是mouse,rat,human的话,可到TRC里面去找预设的shRNA
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-04-03 19:32:46
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gundamba: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-04-07 16:53:35
gundamba: 金币+10 2013-08-01 15:12:08
我一般在后面补两个互补碱基
3楼2013-04-05 22:30:44
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gundamba

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-03 19:32:46
两者都是可以的,不知道你是哪个物种,如果是mouse,rat,human的话,可到TRC里面去找预设的shRNA

多谢您,请问这个TRC是去哪里找呢?
4楼2013-04-07 16:52:11
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kikie

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

http://www.broadinstitute.org/rnai/trc/lib
其实google一下就有了
性痴则志凝,故书痴者文必工,艺痴者技必良;世之落拓无成者,皆自谓不痴者也
5楼2013-04-08 02:24:32
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