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little7tone铁虫 (初入文坛)
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[求助]
引物设计问题，各位大神帮帮忙！！已有1人参与
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小女子走上一条类似转专业的性质。第一次做PCR，好多不懂，各位大神帮帮忙！！！ 要设计鉴定副溶血性弧菌的引物 1、我把目的基因定为它的TLH基因，可是NCBI里面有有关的TLH基因（product="thermolabile），还有TL基因（product="thermolabile hemolysin），有没有大神知道他们是不是一样的？ 2、怎么找目的基因高度保守区？都说是序列比对，怎么比对？怎么blast？  |
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snoopytbw
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【答案】应助回帖
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找到几个可能基因 VS_II0201 Thermolabile hemolysin (TL)-(Lecithin-dependent hemolysin) (LDH) [ Vibrio splendidus LGP32 ] 但是也不是副溶血，是灿烂弧菌 NCBI Reference Sequence: NC_011744.2 Vibrio parahaemolyticus strain C1 Tlh (tlh) gene, partial cds GenBank: JQ929914.1 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;strand=true Vibrio parahaemolyticus strain CECT 5184 thermolabile hemolysin (tl) gene, partial cds GenBank: EU546143.1 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/189031200?report=fasta 知道跟你说的一样么。你在核苷酸（nucleotide）里面找，直接搜 TL或者TLH Vibrio parahaemolyticus |
2楼2014-08-19 13:49:35
little7tone
铁虫 (初入文坛)
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不懂，我是用“TLH Vibrio parahaemolyticus”搜出来是48个，用“TL Vibrio parahaemolyticus”搜出了是13个，这两个基因是一样的吗？3楼2014-08-19 19:17:20