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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 各位大神帮帮忙设计一对引物。
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飘零星lin

金虫 (小有名气)

[求助] 各位大神帮帮忙设计一对引物。 已有7人参与

本人初次接触分子生物学和pcr，现在需要用pcr扩增一段小片段的基因.待扩增片段在附件中。本人菜鸟，求大神帮忙设计一对pcr引物。谢谢
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  • 附件 1 : 待扩增片段.doc
    • 2014-03-18 21:27:41, 23.5 K

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1楼 2014-03-18 21:29:20
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

永峰1230

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-19 18:19:30
primer5...

请问，这个引物是不是只能扩增他的300个序列中的100---280左右呢，，这个不太明白，谢谢你
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12
8楼2014-03-19 21:01:39
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achonghello

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飘零星lin(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-31 19:23:37
第一：把你的序列放在primer premier 5里面进行设计
刷选，然后保存序列
第二：在NCBI BLAST里面验证你设计的引物

前面貌似有人发过帖子primer premier 怎么用，可以看一看
赞一下(1人) 回复此楼
14楼2014-03-20 10:56:56
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普通回帖

Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-03-19 15:59:44
正向5'  AGATGGCTATCATTACTT  3'
反向5'  GAGGCGTTTTATTATTCC  3'
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2楼2014-03-19 10:10:16
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永峰1230

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-19 10:10:16
正向5'  AGATGGCTATCATTACTT  3'
反向5'  GAGGCGTTTTATTATTCC  3'

上楼，是怎么设计 的呢，
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12
3楼2014-03-19 12:36:06
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飘零星lin

金虫 (小有名气)
请问有用软件评价过吗？
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4楼2014-03-19 13:19:44
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飘零星lin

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Fleaves at 2014-03-19 10:10:16
正向5'  AGATGGCTATCATTACTT  3'
反向5'  GAGGCGTTTTATTATTCC  3'

好像不对吧。没有互补配对哦。
赞一下 回复此楼
5楼2014-03-19 13:24:16
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 飘零星lin at 2014-03-19 13:24:16
好像不对吧。没有互补配对哦。...

爱信不信
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6楼2014-03-19 18:18:53
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 永峰1230 at 2014-03-19 12:36:06
上楼，是怎么设计 的呢，...

primer5
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7楼2014-03-19 18:19:30
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 永峰1230 at 2014-03-19 21:01:39
请问，这个引物是不是只能扩增他的300个序列中的100---280左右呢，，这个不太明白，谢谢你...

对的，扩增出来大概100多

[ 发自小木虫客户端 ]
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9楼2014-03-20 00:35:41
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fnlhl

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我怎么都不明白这对引物是怎么出来的，我用http://bioinfo.ut.ee/cgi-bin/primer3-0.4.0/primer3_results.cgi这个网址进去怎么得到的：GCTGGAAAAAGAGAGATGGCTA
ATCGCATGAGGCGTTTTATT？怎么来的啊，请讲讲啊，非常感谢
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10楼2014-03-20 06:26:38
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