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16srDNA

铜虫 (初入文坛)

[求助] 如何做2个定点突变(2个终止密码子换掉)

读文献有几个问题不太懂,特向各位大神求助

有一段目的基因待表达 (支原体的一段基因,要在大肠杆菌中表达),表达前要把这段基因的2个终止密码子换掉,文献中用了3对引物(1对flanking region引物,2对含有mutation引物--每对引物都是overlap的),我的问题是这两个定点突变是怎么做的?

希望大神们帮帮忙,小女子拜谢
附上那篇文献
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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16srDNA(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-16 10:42:35
换终止密码子不用定点突变吧,直接克隆基因的时候,在你设计的引物上去掉终止密码子就行了呀。不是很懂的是为什么会有两个终止密码子?
2楼2013-06-15 21:05:49
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16srDNA

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sun_in_night at 2013-06-15 21:05:49
换终止密码子不用定点突变吧,直接克隆基因的时候,在你设计的引物上去掉终止密码子就行了呀。不是很懂的是为什么会有两个终止密码子?

谢谢你的回复。待表达的基因来自支原体,UGA在支原体中不是终止密码子,但是现在要克隆到pETHIS-1载体上在BL21中表达
3楼2013-06-15 21:23:56
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16srDNA

铜虫 (初入文坛)

我也不清楚这叫不叫定点突变,就是想把两个不同位置的终止密码子换掉,文献中给的两对引物是overlap的,但是文献中引用的文献9,我看不出有什么关联。。。

再附上文献9,求大神指导,小女子不胜感激

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  • 附件 1 : PaperforQuestion9.pdf
  • 2013-06-15 21:35:59, 3.48 M
4楼2013-06-15 21:36:14
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


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16srDNA(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-16 10:42:46
引用回帖:
4楼: Originally posted by 16srDNA at 2013-06-15 21:36:14
我也不清楚这叫不叫定点突变,就是想把两个不同位置的终止密码子换掉,文献中给的两对引物是overlap的,但是文献中引用的文献9,我看不出有什么关联。。。

再附上文献9,求大神指导,小女子不胜感激

我说下我大概浏览后对图1突变方法的理解,,结合问题回答,看能不能帮助你解决你的问题。
为了把在大肠杆菌是终止密码子而在来源生物是翻译为谷氨酰胺的密码子TAA突变为CAA,美国TAA位置应该都会设计一条引物,另外在质粒其他有单一限制性内切酶识别位点的位置突变成另一种限制性内切酶。亲本质粒和突变引物变性退火延伸扩增。扩增产物用内切酶把退火成亲本质粒(没有搭上突变引物扩增的原始质粒)先切开,转化,切开的亲本质粒将不会复制,而一条链是亲本一条链是突变引物扩增的将会在繁殖扩增过程形成带有两条链相同的突变质粒或原始质粒。提取质粒,再次酶切,把原始质粒切开,留下突变质粒,再次转化,提取质粒,这次可以应该大多数是突变了的。再用突变形成的新内切酶位点进行鉴定。
为什么
5楼2013-06-16 00:35:22
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syg00800

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-16 10:42:54
overlap技术是比较麻烦的,目前点突变一般都在质粒上直接突变,你可以查一查相关资料,很简单。
我们为您提供最专业的分子生物学试剂产品和服务
6楼2013-06-16 01:22:55
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sun_in_night

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 16srDNA at 2013-06-15 21:23:56
谢谢你的回复。待表达的基因来自支原体,UGA在支原体中不是终止密码子,但是现在要克隆到pETHIS-1载体上在BL21中表达...

像楼上说的,overlap其实是比较麻烦的,如果不差钱的话还是建议直接买一个site-directed mutagenesis kit,很快的,效率也很高,能节约大量的时间。特别是你要突变两个位点,会更繁琐。不过如果你要换的其中一个位点直接在最后的话,你就设计的引物时候把它改了就行,另一个你就得定点突变了。然后就看你选overlap还是用试剂盒了。
7楼2013-06-16 01:58:49
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547star

木虫 (著名写手)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。期待你的精彩和更详细的解答。 2013-06-16 10:43:05
少说了点,第一次突变引物退火搭上去延伸后直接用连接酶连接(引物应该是磷酸化的)。
个人觉得,这个方法步骤多,花费的时间也比较长。内切酶的酶切效果要求做得好,连接的效果也要做得好,有时候不太容易,因为我们拿到手的时候,酶的质量不够好。感受态效率要求应该还是比较高的。做多个点突变有困难,如果点是分开的,估计只好一次突变一个点,模板质粒选择来酶切筛选的唯一内切酶要来回变。
为什么
8楼2013-06-16 08:39:45
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shanqian1988

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在两个突变位点设计一对引物 ,第一步PCR获得两个突变位点之间的片段,第二步再以第一步PCR产物为引物,以待突变质粒为模板,PCR后,DpnI消化模板后转化就可以了
9楼2013-06-17 10:15:08
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yujitianqing

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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如果实验室经费允许还是买个试剂盒吧,推荐GeneArt® Site-Directed Mutagenesis System,5000元左右。操作说明书里有详细的操作步骤。
10楼2013-06-17 11:32:20
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