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定点突变,请教
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yulou2199
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定点突变,请教
目的基因重组于PHEN 1载体,想对其中的几个位点进行定点饱和突变,通过设计一对互补引物,利用全质粒PCR+dpn 1消化能否实现,试剂盒一般用哪个公司?(实惠点的)
下面是我设计的针对其中一个位点的突变引物,是否可行?
5‘ CGCTTACGGCTTCTTT
NNN
TACTGGGGCCAAGG 3’
3‘ GCGAATGCCGAAGAAA
NNN
ATGACCCCGGTTCC 5’
DNASTAR引物分析:Length: 33, Tm: 73.8, GC%: 60.6
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【求助/交流】定点突变PCR后加DPN1酶的作用
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1楼
2012-12-13 10:31:39
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pennchem
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2012-12-13 19:53:49
amisking: 回帖置顶
2012-12-13 19:53:53
楼主是不是用的点突变试剂盒,里面有一个公式的,按照那个公式算>78度就可以,但是那个公式里面不配对的碱基是减的。
条件允许,买试剂盒做,条件不允许,自己买pfu, dpnI.
试剂盒Stratagene最先研发的,现在好像被安捷伦收购了,国内以前有个公司做过,就不在这里做广告了。
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3楼
2012-12-13 14:32:28
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2012-12-13 19:53:41
最好是引物上设计好酶切位点,以质粒为模板定点突变只扩增目的片段,然后再从新连接载体上。聚合酶用高保真的
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2楼
2012-12-13 13:24:13
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yulou2199
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3楼
:
Originally posted by
pennchem
at 2012-12-13 14:32:28
楼主是不是用的点突变试剂盒,里面有一个公式的,按照那个公式算>78度就可以,但是那个公式里面不配对的碱基是减的。
条件允许,买试剂盒做,条件不允许,自己买pfu, dpnI.
试剂盒Stratagene最先研发的,现 ...
是的,准备用定点突变试剂盒,在stratagene网站上设计得到的引物是:
5'-cttatttctgcgcttacggcttctttnnntactggggccaaggg-3'
3'-gaataaagacgcgaatgccgaagaaannnatgaccccggttccc-5'
Length (nt.) Tm Duplex Energy at 65°C Energy Cost of Mismatches
44 78.91°C -55.71 kcal/mole 9.1%
44bp是不是又点长,Tm>78是不是必须条件?请指教
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4楼
2012-12-13 17:32:13
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escapezrj
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当时我做的时候也是用的试剂盒,感觉蛮轻松愉快的,按着protocol,然后一做就成功啦。
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5楼
2012-12-13 19:43:11
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yandz680717
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可以考虑用overlapping PCR
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6楼
2012-12-13 20:15:00
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pennchem
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Tm值高一些,当然更好,好像也不是非常的严格,有可能,尽量往上靠吧。
44bp长度还不是很极端,我见过更长也做出来的。
用这个方法,用新提取的DNA,提DNA的时候,尽可能的小心,碱裂解的时间不能太长,超螺旋的DNA含量超过80%非常关键。
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7楼
2012-12-14 09:19:37
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