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shining_nana

金虫 (小有名气)

[求助] 大神们,帮忙设计个引物吧!RT-PCR引物设计(大鼠MUC5ac)已有2人参与

请问有大神能帮忙设计个PCR引物吗?最近在做PCR,可是俺是个门外汉,也木有人指导,有个基因怎么也设计不好,总是有引物二聚体或非带,要么就干脆P不出来东西。跪求各位大神帮帮忙啊,帮忙设计个引物吧!基因是大鼠的黏蛋白MUC5ac基因!大鼠MUC5ac啊!
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振作起来,让生活变得多姿多彩!
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-01-09 23:00:22
这个急不来的你可以用primer3 http://biotools.umassmed.edu/bioapps/primer3_www.cgi在网上设计合适的引物再用http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html这个网址验证一下引物可用否。一般就能做出来
hehe
2楼2014-01-09 21:20:12
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shining_nana

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-09 21:20:12
这个急不来的你可以用primer3 http://biotools.umassmed.edu/bioapps/primer3_www.cgi在网上设计合适的引物再用http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html这个网址验证一下引物可用否。一般就能做 ...

我之前用的是primer 5.0,这个在线的没有用过,能不能直接帮忙设计一下啊!拜托啊……
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3楼2014-01-09 21:43:43
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by shining_nana at 2014-01-09 21:43:43
我之前用的是primer 5.0,这个在线的没有用过,能不能直接帮忙设计一下啊!拜托啊……...

你把序列以及要克隆的区域发过来我试试,我主要做植物方向。
hehe
4楼2014-01-09 22:19:36
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shining_nana

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-09 22:19:36
你把序列以及要克隆的区域发过来我试试,我主要做植物方向。...

这个我也不大懂,不是学这个的,我把我能在NCBI上找到的关于大鼠这个基因的都发给你吧。没有特定的克隆区域,只要能设计出个特异性好的引物就可以了。太谢谢你了好人啊!

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  • 2014-01-09 23:08:49, 16.29 K
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  • 2014-01-09 23:09:13, 18.93 K
  • 附件 4 : MUC5ac4.docx
  • 2014-01-09 23:09:19, 18.94 K
振作起来,让生活变得多姿多彩!
5楼2014-01-09 23:09:54
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
shining_nana: 金币+100, ★★★很有帮助 2014-01-10 21:14:09
你试试吧,你的附件二中的序列不全没给你设计。你这几个基因的cDNA序列差异也太大了,是一个基因吗?还是不同的剪切体。

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  • 附件 3 : [emuch.net]MUC5ac4.docx
  • 2014-01-10 11:52:45, 17.65 K
hehe
6楼2014-01-10 11:53:35
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shining_nana

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-10 11:53:35
你试试吧,你的附件二中的序列不全没给你设计。你这几个基因的cDNA序列差异也太大了,是一个基因吗?还是不同的剪切体。

都是从ncbi上download的。我压根就不是学这个的,也不懂……想想我的毕业课题就觉得苦b的要死啊……谢谢你啊!

[ 发自小木虫客户端 ]
振作起来,让生活变得多姿多彩!
7楼2014-01-10 12:02:12
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by shining_nana at 2014-01-10 12:02:12
都是从ncbi上download的。我压根就不是学这个的,也不懂……想想我的毕业课题就觉得苦b的要死啊……谢谢你啊!
...

你最好是找些文献确定一下你的基因。
hehe
8楼2014-01-10 12:13:49
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shining_nana

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-10 12:13:49
你最好是找些文献确定一下你的基因。...

我在文献上看到过这个基因的引物 可是放到primer中打分都不高,就没敢用……

[ 发自小木虫客户端 ]
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9楼2014-01-10 12:23:28
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小牛不白

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用在线的primer 3 试一试,把序列拷进去
10楼2014-01-10 13:35:02
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