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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 水稻RT -PCR引物设计
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swj11123

新虫 (小有名气)

[求助] 水稻RT -PCR引物设计

大家好，我第一次做水稻的RT-PCR，因为我并不会设计引物，所以想请问各位大虾哪里能直接查到水稻各种基因RT-PCR的正反引物，又该这么去查？  先谢谢大家了
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1楼2012-12-12 20:18:55
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wchuangqi

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
swj11123: 金币+5, ★有帮助, 谢啦 2012-12-14 12:00:41
放心，你查不到的。引物只能根据你的实验目的自己设计。劝你还是先学学怎么设计引物吧
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天道酬勤
2楼2012-12-13 13:19:33
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litingwen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
swj11123: 金币+5, ★有帮助, 谢啦 2012-12-14 12:00:31
引物自己设计，NCBI或者Primer5皆可
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3楼2012-12-13 13:57:34
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zwl_8307

银虫 (正式写手)
用Primer5自行设计就行，或者根据文献报道的近亲种的引物来试
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zwl
4楼2012-12-25 10:27:24
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mutant

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyfgood: 金币+3, 应助指数+1, 有帮助！支持一个！ 2012-12-26 15:22:45
水稻基因组已经测序完成，关键是你要先确定你要pcr的基因，通过文献找到基因编号，在NCBI里搜索，然后可以检索出此基因序列，根据此基因序列，利用设计软件，设计引物。当然你要明确是pcr基因全长还是核心序列
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swj11123
5楼2012-12-25 15:35:53
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swj11123

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by mutant at 2012-12-25 15:35:53
水稻基因组已经测序完成，关键是你要先确定你要pcr的基因，通过文献找到基因编号，在NCBI里搜索，然后可以检索出此基因序列，根据此基因序列，利用设计软件，设计引物。当然你要明确是pcr基因全长还是核心序列

但我是要做RT-PCR   是不是有什么特殊要求  谢啦
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6楼2012-12-26 09:47:13
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448935271

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
swj11123: 金币+10, ★有帮助, 好的 thank you 2012-12-28 09:49:39
跨内含子设计引物
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万物皆有毒，只要剂量足
7楼2012-12-27 10:51:26
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nes517

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主先到ncbi找到你要p的目的基因，再用primer5 设计引物，一般没错。
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8楼2013-01-02 17:52:03
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