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swj11123

新虫 (小有名气)

[求助] 水稻RT -PCR引物设计

大家好,我第一次做水稻的RT-PCR,因为我并不会设计引物,所以想请问各位大虾哪里能直接查到水稻各种基因RT-PCR的正反引物,又该这么去查?  先谢谢大家了
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wchuangqi

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swj11123: 金币+5, 有帮助, 谢啦 2012-12-14 12:00:41
放心,你查不到的。引物只能根据你的实验目的自己设计。劝你还是先学学怎么设计引物吧
天道酬勤
2楼2012-12-13 13:19:33
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litingwen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
swj11123: 金币+5, 有帮助, 谢啦 2012-12-14 12:00:31
引物自己设计,NCBI或者Primer5皆可
3楼2012-12-13 13:57:34
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zwl_8307

银虫 (正式写手)

用Primer5自行设计就行,或者根据文献报道的近亲种的引物来试
zwl
4楼2012-12-25 10:27:24
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mutant

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyfgood: 金币+3, 应助指数+1, 有帮助!支持一个! 2012-12-26 15:22:45
水稻基因组已经测序完成,关键是你要先确定你要pcr的基因,通过文献找到基因编号,在NCBI里搜索,然后可以检索出此基因序列,根据此基因序列,利用设计软件,设计引物。当然你要明确是pcr基因全长还是核心序列

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2012-12-25 15:35:53
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swj11123

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by mutant at 2012-12-25 15:35:53
水稻基因组已经测序完成,关键是你要先确定你要pcr的基因,通过文献找到基因编号,在NCBI里搜索,然后可以检索出此基因序列,根据此基因序列,利用设计软件,设计引物。当然你要明确是pcr基因全长还是核心序列

但我是要做RT-PCR   是不是有什么特殊要求  谢啦
6楼2012-12-26 09:47:13
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448935271

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
swj11123: 金币+10, 有帮助, 好的 thank you 2012-12-28 09:49:39
跨内含子设计引物
万物皆有毒,只要剂量足
7楼2012-12-27 10:51:26
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nes517

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主先到ncbi找到你要p的目的基因,再用primer5 设计引物,一般没错。
8楼2013-01-02 17:52:03
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