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xyz7819227

木虫 (正式写手)

[求助] 分子静电势问题,大神进来帮忙看看

根据本版的一些教程,我用gv打开我计算的一个分子的fck文件,想看看他的ESP,我一共计算了3个分子,有两个比较大,另一个比较小。小的那个看ESP没有任何问题,中等大的那个也没问题,现在就是最大的那个分子出现问题了。打开ESP的时候,出现如下的提示
我想问的是,出现了这种情况是因为分子过大造成的吗?还是别的什么原因?
具体应该怎么解决呢?是要转换成cube文件吗,如果是的话要怎么转换呢?请大神们指导指导啊,不甚感激啊

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海纳百川,有容乃大
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-01-24 13:09:16
xyz7819227: 金币+2, 有帮助 2013-01-24 14:27:51
可试一下转换成cube文件:将fck读入multiwfn,写一个ESP的cub文件。
2楼2013-01-23 20:28:06
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-01-23 20:28:06
可试一下转换成cube文件:将fck读入multiwfn,写一个ESP的cub文件。

额...貌似很复杂的样子,我估计是搞不定了,谢谢你
海纳百川,有容乃大
3楼2013-01-24 14:27:44
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huangry2006

木虫 (正式写手)

懒人,任何人也帮不到你。
4楼2013-01-24 14:39:09
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xyz7819227: 金币+8, ★★★★★最佳答案 2013-01-24 18:55:10
当运行Mutiwfn之后,读入你已经准备好的文件:wfn或者fch;
这时出现主菜单,选择5,即要求输出一个三维空间图;
出现次级菜单,选择12,即作ESP;
出现再次级菜单,选择格点的数目,1(低)、2(中)、3(高),选择后即进行计算;
对最后出现的菜单,选择2,即写一个ESP的cub文件。
退出Mutiwfn,在写cub文件的目录中将cub文件改成自己需要的名字。

这cub文件就可以在GV中作图了。

太大的分子可能会在GV中计算出问题。
但由于cub文件的大小只与格点的数目大小有关,与分子大小无关,求得的cub总是可以在GV中作图的。

[ Last edited by zhou2009 on 2013-1-24 at 19:15 ]
5楼2013-01-24 15:14:09
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by huangry2006 at 2013-01-24 14:39:09
懒人,任何人也帮不到你。

不是懒,是根本就不会,我只是个新手,只会一些简单的计算,学的这些完全是靠自学的。也没有机器可以计算,稍微大一点的分子都是找的好心人帮我算的,毕竟我也只是拿理论来作为一种分析的手段,钻研不到那么深
海纳百川,有容乃大
6楼2013-01-24 18:54:09
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xyz7819227

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-01-24 15:14:09
当运行Mutiwfn之后,读入你已经准备好的文件:wfn或者fch;
这时出现主菜单,选择5,要求输出一个三维空间图;
出现次级菜单,选择12,即作ESP;
出现再次级菜单,选择格点的数目,1(低)、2(中)、3(高),选 ...

好专业!    谢了          let me have a try
海纳百川,有容乃大
7楼2013-01-24 18:54:57
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ZJboy

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-01-24 15:14:09
当运行Mutiwfn之后,读入你已经准备好的文件:wfn或者fch;
这时出现主菜单,选择5,即要求输出一个三维空间图;
出现次级菜单,选择12,即作ESP;
出现再次级菜单,选择格点的数目,1(低)、2(中)、3(高), ...

如果只是要cube文件的话,直接在服务器上运行以下指令就可以:
cubegen 0 potential a.fchk a-esp.cube 0 h&
8楼2013-04-21 14:14:29
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