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ckm840529铁杆木虫 (著名写手)
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【求助】蛋白质近表面静电势能模拟 已有2人参与
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| 长期基于实验工作，目前需要补充一些相关的模拟工作，主要是对蛋白质在不同溶剂环境（如盐浓度，pH）中的表面及近表面的静电势能做模拟分析。找到了可能的模拟软件为DelPhi和Pymol，但是小弟不才，很难入门。不知各位大虾有没有涉及这方面的工作，或者还有什么其他的模拟软件可以实现模拟表面静电势能呢？感谢你们的赐教。 |
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ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 09:55:43
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-07-19 09:55:43
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你说的是另一个问题 Poisson-Boltzmann方程一般是用于电子迁移率的计算上 国内有人用的 建议你去阅览帅志刚、王曙光老师的工作 他们在计算静电势能时 考虑了原子核的影响 PyMOL_APBS 这个软件确实是可以计算静电势能的 马路 周果宏 （首都医科大的）曾经写过关于DelPhi的计算 但都没有涉及关于PH值的计算 Poisson-Boltzmann方程 我不太了解是否能用于蛋白质的计算 希望你阅读了帅老师的工作 能有启发 |
4楼2010-07-19 08:33:10
