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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 序列比对后怎么设计RACE的特异性引物
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thinkerboy

铁虫 (小有名气)

[求助] 序列比对后怎么设计RACE的特异性引物

导师要求我调出鸡的nod2基因，但genebank上没有报道过鸡的nod2序列。
所以我就在genebank上找了其他物种的nod2mRNA序列用DNAman进行了比对截图如下
然后根据比对的保守序列设计引物做RACE——pcr。现在问题就是比对的结果是不连续的片段如上图所示，我要怎么根据上面的结果设计兼并引物，有什么软件吗，pp5貌似不能设计兼并引物的啊！！求做过这方面的告知啊

序列比对结果.PNG
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1楼 2012-12-10 23:39:52
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thinkerboy

铁虫 (小有名气)
感谢
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2楼2012-12-10 23:41:46
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
thinkerboy: 金币+2 2012-12-16 01:42:02
设简并引物应对是氨基酸序列比对的结果，不是核苷酸序列。PP5是可以设计兼并引物的。
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3楼2012-12-11 09:52:50
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thinkerboy

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hlwnxfd2011 at 2012-12-11 09:52:50
设简并引物应对是氨基酸序列比对的结果，不是核苷酸序列。PP5是可以设计兼并引物的。

pp5可以设计兼并引物吗，能给个截图不，具体哪个按钮啊，十分感谢
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4楼2012-12-11 21:56:44
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