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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于引物设计的问题
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sugar900309

木虫 (小有名气)

[求助] 关于引物设计的问题

我要克隆一个基因 然后表达，但这个基因cds前面只有九个碱基，我该怎么设计引物？如何找前人做过的关于这个基因的资料？
引物长度一个16bp,一个17bp，Tm值51℃，可以用吗？有什么影响
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1楼 2012-04-05 20:45:42
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 呵呵 2012-04-06 08:59:21
1 “但这个基因cds前面只有九个碱基”不太明白楼主的意思
2 如何找前人做过的关于这个基因的资料
  最简单，把你所做基因全称，到NCBI查一查，序列信息和相关文献都可以找到
3 引物长度一个16bp,一个17bp，Tm值51℃，可以用吗？
  试试看
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
2楼2012-04-05 21:16:18
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qjy_134

铜虫 (小有名气)
你就是要把他克隆到表达载体了，跟前面的碱基有什么关系
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3楼2012-04-05 21:55:41
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sugar900309

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-04-05 21:16:18:
1 “但这个基因cds前面只有九个碱基”不太明白楼主的意思
2 如何找前人做过的关于这个基因的资料
  最简单，把你所做基因全称，到NCBI查一查，序列信息和相关文献都可以找到
3 引物长度一个16bp,一个17bp，Tm值 ...

就是起始密码子前面只有九个碱基，要怎么设计引物才能将整个基因扩出来？
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4楼2012-04-06 09:20:18
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hyacinth326

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-08 16:36:47
sugar900309: 金币+1, ★有帮助 2012-04-10 08:18:59
内容已删除
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5楼2012-04-06 10:05:19
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sugar900309

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hyacinth326 at 2012-04-06 10:05:19:
这个没有问题吧，我们经常直接从起始密码子开始设计引物，不断调整引物的长度，然后找到一对最好的引物，像这种情况，引物肯定不可能尽善尽美，这没有办法，没有最好只有更好，哈哈。。。TM值51确实有点低啊，一般 ...

那终止密码子可以编在引物里吗，我要克隆的基因在NCBi上下的序列终止密码子后面也只有20个碱基 对于我这种初学者要设计合适的引物真的好难啊
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6楼2012-04-07 21:21:13
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