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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

[求助] pMD-19T载体与目的片段的连接问题已有6人参与

之前计划目的基因(3.6Kb)与pMD-19T进行TA克隆连接,目的片段用primerstar高保真酶后加A连接,氨苄板生长,鉴定后发现是载体自连;后来用Taq酶PCR扩增后直接与pMD-19T载体链接,最后发现还是自连的···发现这都不行后就进行一步克隆(ClonExpressTM快速克隆技术),之前认为在载体是线性的,就直接连了,但是没有连上,氨苄平板上没长;后来用以前构建好的质粒进行双酶切后进行一步克隆,可是氨苄平板上还是没有长···各位大神,求助···
转化条件:
感受态是自己用氯化钙法做的,以前也是用它来做转化,都可以的···
热击90s后,37℃活化1h后,将转化液浓缩全部涂平板···
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by kuaile5420 at 2014-07-25 11:38:57
你用Taq DNA聚合酶进行PCR之后进行相应的酶切就直接连接载体了吗?

之前认为是Taq酶P出来就存在A尾,就直接连接了,发现载体自连了,后来P出来之后,又用加A试剂盒加A尾进行连接转化,鉴定后还是没连上···
···
8楼2014-07-25 13:16:26
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kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-25 13:16:26
之前认为是Taq酶P出来就存在A尾,就直接连接了,发现载体自连了,后来P出来之后,又用加A试剂盒加A尾进行连接转化,鉴定后还是没连上···...

加A试剂盒不会有问题吧?转化后是怎么鉴定的啊?
坚持到底就是胜利!
10楼2014-07-25 14:52:32
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sj082csh

银虫 (小有名气)


小冀-(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-26 17:01:44
你好,可能是你的目的片段太长了。。 建议您换一下连接体系。 PMD19-T中,T4连接酶在solution I 里,好像本身连接效率就不高,况且你的片段3.6K
14楼2014-07-25 23:21:31
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-26 12:39:37
这是普通的酶切链接吧,我也在考虑做三个浓度梯度进行连接,以上我做的是一步克隆,都没有连上···...

你的不是加A了吗?   这样是可以的。就是TA克隆嘛
片段加3ul
24楼2014-07-26 14:39:47
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usky_4

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小冀-: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-07-27 12:08:48
引用回帖:
18楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-26 09:29:18
DNA:0.5u(71.5ng)
buffer:4u
enzyme:2u
PMD-19T:5.2u(54.08ng)
H2O:8.3u...

你的目的基因这么大,DNA量加的不够。连接体系里的DNA分子数大概是载体量的3-5倍。你的片段和载体差不多一样大,那么你加入的DNA重量至少要是载体的三倍。建议你做个梯度,3:1,4:1,5:1这样。因为目的片段基本上和载体差不多大甚至比载体更大,连接会比较困难。
下次再见面的时候,我们一定会笑着相遇吧
26楼2014-07-26 17:30:40
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风灵之翼

金虫 (初入文坛)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-07-29 16:06:17
给你个可以连接的方法,按照标准体系配置完成后,将反应体系放在4度冰箱的门上,门上温度大约在10度左右,连接过夜或者24小时,成功几率很大

[ 发自小木虫客户端 ]
28楼2014-07-28 16:52:28
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普通回帖

鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-25 10:54:32
我觉得第一次做的比较好,因为第二次你没有纯化。
个人觉得是你连接体系出问题了,你可以把具体信息写下来给你看看。
热击90s后,要记得冰上5min,然后加SOC,再37度恢复培养。
2楼2014-07-25 10:20:16
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
连接效率太低,PCR产物要纯化
3楼2014-07-25 11:33:56
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kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你用Taq DNA聚合酶进行PCR之后进行相应的酶切就直接连接载体了吗?
坚持到底就是胜利!
4楼2014-07-25 11:38:57
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panhp2004

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-07-25 13:58:12
构建质粒的一般步骤:
扩增目的基因---PCR产物纯化,加17ul 洗脱液洗脱(PCR产物纯化试剂盒做)---双酶切,30或50ul 体系,纯化后的PCR产物取 10ul,载体取 3ul,37度 约3-4h---胶回收(胶回收试剂盒做),加17ul 洗脱液洗脱----连接,16度,约3-4h----转化,热激时,42度,40 s 即可----后培养,加200 ul  液体LB ,37度静止培养 1 h----取200 ul 涂氨苄。
追梦是一个快乐的过程。
5楼2014-07-25 13:11:27
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小冀-

版主 (著名写手)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by 鬼羽帝魂 at 2014-07-25 10:20:16
我觉得第一次做的比较好,因为第二次你没有纯化。
个人觉得是你连接体系出问题了,你可以把具体信息写下来给你看看。
热击90s后,要记得冰上5min,然后加SOC,再37度恢复培养。

纯化是什么意思?载体和目的片段都是跑胶回收的···热击后,我冰浴了2min,然后才活化的···
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6楼2014-07-25 13:13:11
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小冀-

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引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2014-07-25 11:33:56
连接效率太低,PCR产物要纯化

载体和目的片段都是跑胶回收过的,应该算是纯化了吧···
···
7楼2014-07-25 13:14:06
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小冀-

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引用回帖:
5楼: Originally posted by panhp2004 at 2014-07-25 13:11:27
构建质粒的一般步骤:
扩增目的基因---PCR产物纯化,加17ul 洗脱液洗脱(PCR产物纯化试剂盒做)---双酶切,30或50ul 体系,纯化后的PCR产物取 10ul,载体取 3ul,37度 约3-4h---胶回收(胶回收试剂盒做),加17ul  ...

步骤我都知道的···
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9楼2014-07-25 13:17:33
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