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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-25 13:13:11
纯化是什么意思?载体和目的片段都是跑胶回收的···热击后,我冰浴了2min,然后才活化的···...

纯化就是跑胶回收,现在看来最大可能是连接这里有点小问题了吧。
11楼2014-07-25 15:04:06
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

把连接体系写上来,以及片段载体多大,浓度多大。
12楼2014-07-25 15:05:20
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usky_4

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-07-25 21:58:19
小冀-: 金币+1, 有帮助 2014-07-26 09:24:40
这个载体应该是可以做蓝白斑筛选的吧,做个蓝白斑很容易就能看出来有没有插入基因。一般白斑的插入率应该有90%,你的目的片段略大,可能会稍微低一些。确认一下这个大小是否超过了载体的上限。

不知道你的连接体系是怎样的,你的片段跟载体的大小基本差不多,所以要多加目的片段进行连接,用3:1甚至5:1的比例,加大目的片段的插入效率。没用过这个载体,也确认一下这个载体是不是能直接用来TA克隆。

至于你后来说的双酶切后进一步克隆,体系是怎样的?你的目的基因有相应的酶切位点么?
下次再见面的时候,我们一定会笑着相遇吧
13楼2014-07-25 21:29:31
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sj082csh

银虫 (小有名气)


小冀-(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-26 17:01:44
你好,可能是你的目的片段太长了。。 建议您换一下连接体系。 PMD19-T中,T4连接酶在solution I 里,好像本身连接效率就不高,况且你的片段3.6K
14楼2014-07-25 23:21:31
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gaoyu_8848

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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小冀-: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-07-26 09:30:56
原因是片段太长, 3.6K要连上去很难,因为载体也差不多是这么大。考虑把3.6k扩3个小1k左右的小片段,分步连上去。需要找到重合处的唯一内切酶位点。
15楼2014-07-26 00:15:41
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小冀-

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15楼: Originally posted by gaoyu_8848 at 2014-07-26 00:15:41
原因是片段太长, 3.6K要连上去很难,因为载体也差不多是这么大。考虑把3.6k扩3个小1k左右的小片段,分步连上去。需要找到重合处的唯一内切酶位点。

这样的话,如果3个小片段有任何一个出现问题,那我的蛋白不就表达不了了吗???
···
16楼2014-07-26 09:22:22
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小冀-

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引用回帖:
13楼: Originally posted by usky_4 at 2014-07-25 21:29:31
这个载体应该是可以做蓝白斑筛选的吧,做个蓝白斑很容易就能看出来有没有插入基因。一般白斑的插入率应该有90%,你的目的片段略大,可能会稍微低一些。确认一下这个大小是否超过了载体的上限。

不知道你的连接体 ...

一步克隆时只是在双切基础上加了一段同源臂,目的基因里没有双切用到的两种酶,都是设计引物的时候加上去的···
···
17楼2014-07-26 09:24:28
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小冀-

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12楼: Originally posted by 鬼羽帝魂 at 2014-07-25 15:05:20
把连接体系写上来,以及片段载体多大,浓度多大。

DNA:0.5u(71.5ng)
buffer:4u
enzyme:2u
PMD-19T:5.2u(54.08ng)
H2O:8.3u
···
18楼2014-07-26 09:29:18
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
18楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-26 09:29:18
DNA:0.5u(71.5ng)
buffer:4u
enzyme:2u
PMD-19T:5.2u(54.08ng)
H2O:8.3u...

你的DNA片段是多少bp?
19楼2014-07-26 10:34:06
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鬼羽帝魂

木虫 (著名写手)

★ ★
小冀-(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-07-26 17:02:12
引用回帖:
18楼: Originally posted by 小冀- at 2014-07-26 09:29:18
DNA:0.5u(71.5ng)
buffer:4u
enzyme:2u
PMD-19T:5.2u(54.08ng)
H2O:8.3u...

按这个体系做下:
PMD-19T:  5ul  【0.03pmol】
DNA:   99*DNA大小/(1000*140)ul  【0.15pmol】
5Xbuffer:   2ul
enzyme:   1ul
补水到10ul。
16度连接8-10h,做转化。
20楼2014-07-26 10:42:10
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