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lvye3707

金虫 (正式写手)

[求助] 目的片段和pMD18-T simple vector 的连接已有1人参与

我做了四次了,目的片段保存在菌液里,用含有酶切位点的正向引物和反向引物扩增条带很亮,胶回收很亮,用TAKARA试剂盒连接16℃ 14--16h,转化自制的大肠杆菌DH5α,涂在氨苄抗性的板上,板上能长10+个斑,挑其中的6个,全是假阳性的,求大侠了
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王文钊-

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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lvye3707: 金币+5, 谢谢啊,我换个感受态试试 2012-12-02 20:47:10
lvye3707: 回帖置顶 2012-12-03 09:33:53
感觉可能是感受态有问题了,我们有时候用自己做的感受态也有问题,后来买了试剂公司的感受态,就做出来了。用过TAKARA的DH5a,还有全式金的trans-T1
14楼2012-11-30 20:39:54
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ym6104

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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lvye3707: 金币+5, 有帮助, 可我的菌长啊,这可能是的?感受态怎么影响 2012-12-02 20:48:35
lvye3707: 回帖置顶 2012-12-03 09:33:57
之前也出现过楼主的这种情况,后来换成全式金的T1,就没出现过了。。。如果找不到其他原因的话,可以考虑换个感受态试试。。。
15楼2012-11-30 23:00:21
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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lvye3707: 金币+5, 有帮助, 谢谢 2012-11-29 20:48:28
还有就是你的连接是连了十多个小时,我记得T载体连接时间挺短的啊,一般是在一个小时以内,你最好看看说明书吧~
比例的问题的话,其实应该少加载体多加片段才对~
8楼2012-11-29 19:56:16
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wangqi20092

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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lvye3707: 金币+5, 有帮助, 春哥有用的话,我都想拜他八辈祖宗了 2012-12-02 21:46:12
第一,确定你用的PCR酶是不是在末尾加A了?第二,确定你的连接体系按说明书做的,混匀再16度连接;第三,保证你的氨苄浓度是100mg/mL,是LB培养基;第四,保证你的感受态能用;第五,转化过程确定你用的是冰浴30min,42度90s,冰2min,然后加800ul LB,不含抗生素,170rpm摇1h涂板。如果以上问题都正确,再不出来,那就拜拜春哥吧!!!
10楼2012-11-30 10:50:46
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普通回帖

bloodwar

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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lvye3707: 金币+5, 有帮助 2012-11-29 08:37:21
你是做T-A连接的吗,含有酶切位点最好是双酶切后再连啊,用Promega的pGET载体试试吧
2楼2012-11-29 05:18:53
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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lvye3707: 金币+5, 有帮助 2012-11-29 15:00:22
连接转化后,涂板前培养菌液后,请用通用引物和你自己的特异引物同时做菌落PCR来检测,确定连接是成功的而不是载体自连。
3楼2012-11-29 08:46:43
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lvye3707

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chenguestc at 2012-11-29 08:46:43
连接转化后,涂板前培养菌液后,请用通用引物和你自己的特异引物同时做菌落PCR来检测,确定连接是成功的而不是载体自连。

转化培养菌液后,我用含酶切位点的引物菌液PCR,跑出来的都是空条带,说明是载体自连么?
4楼2012-11-29 15:00:09
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lvye3707: 金币+5, 有帮助, 也换过其他的试剂盒,TA克隆对PCR产物末端有要求么? 2012-11-29 15:32:31
引用回帖:
4楼: Originally posted by lvye3707 at 2012-11-29 15:00:09
转化培养菌液后,我用含酶切位点的引物菌液PCR,跑出来的都是空条带,说明是载体自连么?...

是的。如果目的片段过长,可考虑用不同的酶切成几个CONTIG后再连接。
如果片段不长,那么可以考虑换一个连接试剂盒,重新回收DNA连接,全套都换新的,否则老是到处找原因也很难找的到。
5楼2012-11-29 15:23:25
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer

【答案】应助回帖

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lvye3707: 金币+5, 有帮助, 目的片段过多有什么影响么? 2012-11-29 19:50:39
lvye3707: 金币+25 2012-11-29 19:52:16
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-03 08:32:28
1:你用的什么酶PCR,Taq?pfu之类的高保真?后者要自己加A尾,不然连接不上T载体.
2:连接比例的问题,比例不对也容易造成载体自连.
Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
6楼2012-11-29 15:45:45
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zhjzhou

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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lvye3707: 金币+5, 出现假阳性和感受态有关么? 2012-11-29 19:51:16
引用回帖:
6楼: Originally posted by Marado at 2012-11-29 15:45:45
1:你用的什么酶PCR,Taq?pfu之类的高保真?后者要自己加A尾,不然连接不上T载体.
2:连接比例的问题,比例不对也容易造成载体自连.

是的,T载体很好连接的,主要是看你PCR的时候用的是什么酶,否则要加A才能连上,要是一般的Taq酶,就不用加A了,直接连接,一般都能连接上的,转化产物要是只长几个斑,一般不是,最起码要比较均匀的,长几十个才比较正常。
7楼2012-11-29 16:57:22
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer

【答案】应助回帖

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lvye3707: 金币+5, 有帮助, 谢谢,我试下 2012-12-02 20:44:57
目的片段过多影响与载体的碰撞几率,从而影响连接效率.
Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
9楼2012-11-30 09:51:40
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