24小时热门版块排行榜    

查看: 1362  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

nlhnq55

银虫 (小有名气)

[求助] 活性污泥中DNA模板的提取成功,但PCR扩增不出条带。 已有3人参与

使用FastDNA® SPIN kit for Soil分别提取 “土壤” “活性污泥” 中的细菌DNA模板,总DNA模板直接电泳检测,条带都非常亮。但是PCR扩增16S rRNA基因,只有土壤的模板正常出带 活性污泥的样品不出带 ,或者条带非常非常弱和弥散

我看文章中,大家都使用这个试剂盒提取活性污泥中的DNA模板的,为什么我用就不行了呢?
不换了多个活性污泥样品,结果一样的。
PCR扩增其他的基因,也是上面一样的结果。

非常着急,困扰我的实验很久了,一直解决不了啊
大家遇到过类似的情况吗 ? 请帮我分析分析吧
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

无穷般若心自在,语默动静体自然
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolale

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
nlhnq55: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-06-28 21:41:57
发酵残余物和活性污泥的DNA提取好像和土壤不太一样,我自己也快要提了,不过还没试过。降低腐植酸好像是一点【秸秆沼气干发酵基质中微生物dna 提取方法筛选】,然后就是提取效率,就是能提出来的DNA占总量的多少(一般偏低)【Evaluation of several DNA extraction methods for obtaining total community DNA from anaerobic digestion sludge】。
文献没找到多少,我也还再研究
3楼2014-06-27 23:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

肥猫p

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励应助 2014-06-21 14:28:34
nlhnq55: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-06-28 21:40:18
会不会是因为提取物中含有较多腐殖酸等抑制pcr的物质。
个人建议从2方面入手:
1,用dd水稀释你的基因组,减少pcr体系中基因组的加入量。
2,使用扩增复杂模板的酶,并且酶适量多加一些。
2楼2014-06-20 23:35:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

RuyangHan

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

顶肥猫P的说法。你用的DNA量是多少ng? 建议试试1ng 或 0.1ng做PCR模板。还有你说有浅的条带,也可以取1uLPCR产物做模板重新PCR。
5楼2014-08-22 22:55:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:50 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-15 06:49 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:14 by 5BDX0d0WFp7t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:50 by 5BDX0d0WFp7t
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-15 05:49 by 5BDX0d0WFp7t
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 05:34 by 5BDX0d0WFp7t
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 3/150 2026-09-15 05:26 by 5BDX0d0WFp7t
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-15 05:00 by mibUvS8DDCwf
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 00:12 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-14 23:24 by vZfe6xYu34yj
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 23:13 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:25 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:13 by vZfe6xYu34yj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 4/200 2026-09-14 21:37 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 18:01 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
请填处理意见