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OVER-LAP PCR第二轮扩增不出来条带
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rainbow8
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OVER-LAP PCR第二轮扩增不出来条带
已有1人参与
构建质粒,用overlapPCR,一个小片段(1k),线性质粒(6k)单独P的时候都P出来了 小片段37ng/ul,大片段5ng/ul,两个片段overlap的时候却p不出来了 我用100ul的体系,引物两个各家4ul,模板等摩尔加的,没有条带。。。请求各位高手帮忙解决。
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学海无涯,回头是岸
1楼
2012-04-13 19:15:11
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xinshen0915
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【答案】应助回帖
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2012-05-28 16:02:06
1、换个小点的体系,用20ul的体系试一下;
2、可以考虑把两个片段回收之后再做模板,我以前做overlapping也遇到过这种情况,将片段回收之后做模板就扩出来了;
3、确保两条引物的退火温度相差不大于5度,可以考虑梯度扩增。
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Go home or stand up!It's your fucking choice.Do you still remember the reason why you are here?
2楼
2012-04-13 20:01:53
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rainbow8
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2楼
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xinshen0915
at 2012-04-13 20:01:53:
1、换个小点的体系,用20ul的体系试一下;
2、可以考虑把两个片段回收之后再做模板,我以前做overlapping也遇到过这种情况,将片段回收之后做模板就扩出来了;
3、确保两条引物的退火温度相差不大于5度,可以考 ...
什么是梯度扩增?
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学海无涯,回头是岸
3楼
2012-04-14 21:28:18
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2楼
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xinshen0915
at 2012-04-13 20:01:53:
1、换个小点的体系,用20ul的体系试一下;
2、可以考虑把两个片段回收之后再做模板,我以前做overlapping也遇到过这种情况,将片段回收之后做模板就扩出来了;
3、确保两条引物的退火温度相差不大于5度,可以考 ...
我的退火温度都是55℃
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学海无涯,回头是岸
4楼
2012-04-14 21:30:25
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【答案】应助回帖
一楼,楼主都分别说出两个片段的浓度了,当然是回收过了的呀。我觉得你的大片段是??是浓度有点太低了,纯度太低。最好用它当模?????扩一次,最好两个片段的浓度相当。
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5楼
2012-05-28 14:36:57
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4楼
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rainbow8
at 2012-04-14 21:30:25
我的退火温度都是55℃...
退火温度高点,还有你的模板浓度太低,5ng太低,可能都不是DNA
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6楼
2016-10-09 17:55:14
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7楼
2016-10-09 22:45:12
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