24小时热门版块排行榜    

查看: 5128  |  回复: 6

108391

铜虫 (初入文坛)

[求助] PCR酶切位点的保护碱基可以随意设置吗? 已有5人参与

我正在从细菌基因组里P目的基因,引物设计上遇到问题,上游需设计Nde I酶切位点,下游设计Xho I酶切位点。实验室有人告诉我在网上下载酶切位点的保护碱基来加,但有人告诉我随便加2-3个碱基,比如下游加上Xho I是这样CCG CTCGAG+下游引物,如果随便加碱基的话就是这样ATA CTCGAG+下游引物。
请问大家都是怎样设计的,分析一下您的经验!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我做ta克隆的,不加保护碱基

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-05-26 22:36:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghqiu09

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

3楼2014-05-26 22:39:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bonbonzd

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-27 14:09:05
根据引物的GC含量随便添加就可以,使添加完后GC含量相差不多就可以
4楼2014-05-27 13:10:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白菜吃虫

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是随便加的,有一定的规律,你在网上搜索一下“酶切位点保护碱基”,能查到的。
5楼2014-05-27 13:47:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你实验室人告诉你的随意加的意思是,保护碱基跟个数有关而和具体加什么碱基无关,但一般会根据序列来加,如果你的引物GC含量好,就尽量加A和T,如果AT含量高就尽量加G和C
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2014-05-27 14:12:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

108391

铜虫 (初入文坛)

谢谢各位的热心建议,我还是用了在百度上搜的保护碱基,Xho I的是CCG CTCGAG而且下游正好T含量高,GC少,“gyesang”正解哈
7楼2014-05-27 20:01:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 108391 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 05:13 by winsaint
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +7 苏东坡二世 2026-08-23 7/350 2026-08-27 18:14 by 瞬息宇宙
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见