24小时热门版块排行榜    

查看: 4803  |  回复: 6

108391

铜虫 (初入文坛)

[求助] PCR酶切位点的保护碱基可以随意设置吗? 已有5人参与

我正在从细菌基因组里P目的基因,引物设计上遇到问题,上游需设计Nde I酶切位点,下游设计Xho I酶切位点。实验室有人告诉我在网上下载酶切位点的保护碱基来加,但有人告诉我随便加2-3个碱基,比如下游加上Xho I是这样CCG CTCGAG+下游引物,如果随便加碱基的话就是这样ATA CTCGAG+下游引物。
请问大家都是怎样设计的,分析一下您的经验!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我做ta克隆的,不加保护碱基

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-05-26 22:36:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghqiu09

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

3楼2014-05-26 22:39:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bonbonzd

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-27 14:09:05
根据引物的GC含量随便添加就可以,使添加完后GC含量相差不多就可以
4楼2014-05-27 13:10:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白菜吃虫

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是随便加的,有一定的规律,你在网上搜索一下“酶切位点保护碱基”,能查到的。
5楼2014-05-27 13:47:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你实验室人告诉你的随意加的意思是,保护碱基跟个数有关而和具体加什么碱基无关,但一般会根据序列来加,如果你的引物GC含量好,就尽量加A和T,如果AT含量高就尽量加G和C
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2014-05-27 14:12:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

108391

铜虫 (初入文坛)

谢谢各位的热心建议,我还是用了在百度上搜的保护碱基,Xho I的是CCG CTCGAG而且下游正好T含量高,GC少,“gyesang”正解哈
7楼2014-05-27 20:01:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 108391 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +7 不知道叫什么! 2026-03-15 8/400 2026-03-15 20:11 by 棒棒球手
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +14 王晓阳- 2026-03-09 19/950 2026-03-14 02:05 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +5 简木ChuFront 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:29 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕,一志愿中国矿业大学,总分314,求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] (081700)化学工程与技术-298分求调剂 +12 11啦啦啦 2026-03-11 35/1750 2026-03-13 21:25 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 莫xiao 2026-03-10 4/200 2026-03-11 08:06 by 斩魂滴兔子!
信息提示
请填处理意见