24小时热门版块排行榜    

查看: 15372  |  回复: 4

aoda123

木虫 (正式写手)

[求助] BsaI的酶切位点怎么看?

求助,BsaI的酶切位点怎么看?
   5’.....GGTCTC(N)1.....3‘
   3’.....CCAGAG(N)5......5‘
      上面的N代表什么啊?
回复此楼
身体健康,工作顺利
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

anyaxiong

铁杆木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2013-11-11 21:29:19
N 代表没有测定的碱基。比如在测序过程中出现gap,那么这一段都用N来代替这些还没有测序、尚不明确的碱基。U不会出现在DNA序列中。U在分子生物学中表示碱基时只代表尿嘧啶。还有,提供给楼主一些常用的简并碱基代码。也就是说,可以用一个字母表示几种碱基。简并/混合碱基 A+C+G → V简并/混合碱基 A+T+G → D简并/混合碱基 T+C+G → B简并/混合碱基 A+T+C → H简并/混合碱基 A+T → W简并/混合碱基 C+G → S简并/混合碱基 T+G → K简并/混合碱基 A+C → M简并/混合碱基 C+T → Y简并/混合碱基 A+G → R简并/混合碱基 A+G+C+T → N楼主所说的N,其实就是最后一种情况,N可以代表A G C T 中的任何一个,常用在测序结果的gap中,以及设计简并引物的过程中。
爱拼才会赢
2楼2013-11-11 20:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
N代表任意碱基,BsaI切割位点在识别序列后面,跟位置有关,跟具体是什么碱基无关
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-11-11 21:30:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aoda123

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by anyaxiong at 2013-11-11 14:07:56
N 代表没有测定的碱基。比如在测序过程中出现gap,那么这一段都用N来代替这些还没有测序、尚不明确的碱基。U不会出现在DNA序列中。U在分子生物学中表示碱基时只代表尿嘧啶。还有,提供给楼主一些常用的简并碱基代码 ...

那么,N后面的1或者5代表什么呢?
身体健康,工作顺利
4楼2013-11-11 21:33:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by aoda123 at 2013-11-11 21:33:57
那么,N后面的1或者5代表什么呢?...

意思就是  5’.....GGTCTCN^NNNNN .....3‘
              3’. ....CCAGAGNNNNN^N......5‘  
这个符号^表示cut
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-11-12 01:34:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 aoda123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +4 2117205181 2026-03-21 5/250 2026-03-22 11:30 by 杨杨杨紫
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +5 生物工程调剂 2026-03-17 9/450 2026-03-21 23:32 by zhujy1982
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +6 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 7/350 2026-03-21 01:03 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见