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aoda123木虫 (正式写手)
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[求助]
BsaI的酶切位点怎么看？
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求助，BsaI的酶切位点怎么看？ 5’.....GGTCTC（N）1.....3‘ 3’.....CCAGAG（N）5......5‘ 上面的N代表什么啊？ |
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gyesang
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5楼2013-11-12 01:34:12
anyaxiong
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励交流！ 2013-11-11 21:29:19
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励交流！ 2013-11-11 21:29:19
| N 代表没有测定的碱基。比如在测序过程中出现gap，那么这一段都用N来代替这些还没有测序、尚不明确的碱基。U不会出现在DNA序列中。U在分子生物学中表示碱基时只代表尿嘧啶。还有，提供给楼主一些常用的简并碱基代码。也就是说，可以用一个字母表示几种碱基。简并/混合碱基 A+C+G → V简并/混合碱基 A+T+G → D简并/混合碱基 T+C+G → B简并/混合碱基 A+T+C → H简并/混合碱基 A+T → W简并/混合碱基 C+G → S简并/混合碱基 T+G → K简并/混合碱基 A+C → M简并/混合碱基 C+T → Y简并/混合碱基 A+G → R简并/混合碱基 A+G+C+T → N楼主所说的N，其实就是最后一种情况，N可以代表A G C T 中的任何一个，常用在测序结果的gap中，以及设计简并引物的过程中。 |
2楼2013-11-11 20:07:56
gyesang
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3楼2013-11-11 21:30:31
aoda123
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