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湖畔狂想金虫 (小有名气)
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菌液PCR的假阳性是什么原因造成的?
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最近做实验时遇到这样的问题: 将目的片段与表达载体连接后,转入大肠杆菌,对其菌液PCR验证时有目的条带(同时还做了用水替代菌液的阴性对照,结果没有目的条带),但是再用酶切验证时发现,没有切下目的片段。 想知道这算假阳性吗?是什么原因造成的? 求高人指点!万分感谢! |
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以下均为网络资源: 引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行 PCR 扩增时,扩增出的 PCR 产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。 靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及样进枪头等均应一次性使用。必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出 PCR 产物,而导致假阳性的产生,可用巢式 PCR 方法来减轻或消除。 |
2楼2014-02-22 10:59:02
gyesang
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