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易翔仪冲

新虫 (初入文坛)

[交流] 转化之前如何验证连接是否成功 已有11人参与

将双酶切的目的片段与双酶切的载体进行连接,在转化之前,怎么判断有没有连起来?跑胶验证可以吗?
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

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kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-07-12 21:52:51
1949stone: 回帖置顶 2013-07-17 11:08:36
不是啦,空载体理论上是不会长斑的,因为被切开的载体是不能表达的,所以在抗性板上长不了。但是如果酶切不完全,或者载体有自连,那就也能长斑。
楼主想知道连接、转化的效果好不好,那就应该做个空白对照。也就是在你连接的时候,同时做一管只加载体不加外源片段的连接,转化的时候也拿这管空载体的连接产物去做转化。正常情况下空白对照的板长出来的菌应该很少,起码要明显比实验组少。如果空白对照的板都长了一堆,那最好不要往下筛了,重新酶切载体、连接、转化。硬要往下做的话,做好心理准备,因为大部分菌斑是阴性的。
如果想减少自连,可以在酶切了载体之后,对载体去磷。
8楼2013-07-12 21:37:33
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普通回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)


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没听说过有这种方法,看看有没有高人指点下。不过连接上的产物一般量很少,跑胶是看不出来的。
2楼2013-07-12 20:59:56
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547star

木虫 (著名写手)


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想到一个办法,因为平时连接转化都没问题,就没做实验。没经过验证,就不说了。
为什么
3楼2013-07-12 21:10:46
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Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)


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反正一个引物在backbone上 一个在insert上,PCR能P出来,不过我基本都是做colony pcr时候找不到阳性对照才这么P的,我也没怎么连接转化失败过。
4楼2013-07-12 21:14:40
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易翔仪冲

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 西瓜 at 2013-07-12 20:59:56
没听说过有这种方法,看看有没有高人指点下。不过连接上的产物一般量很少,跑胶是看不出来的。

那我转化之后的话长的斑也会是空载体的比较多了?
5楼2013-07-12 21:19:58
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易翔仪冲

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Haibara_Ai at 2013-07-12 21:14:40
反正一个引物在backbone上 一个在insert上,PCR能P出来,不过我基本都是做colony pcr时候找不到阳性对照才这么P的,我也没怎么连接转化失败过。

我转化之后,张了好多斑,但是挑菌摇菌提取质粒之后,双酶切没有获得目的条带
6楼2013-07-12 21:23:23
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Haibara_Ai

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
做不出来可能问题很多,详细描述下过程

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2013-07-12 21:31:51
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

★ ★
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-15 20:17:46
可以使用质谱对于认为连接好的质粒检测相对分子量,参考对对未连接的质粒和需要连接的DNA片段的相对分子量。
9楼2013-07-12 22:09:14
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yb19841014

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以跑胶看的。要看你的插入片段大小了。如果是500bp以上的,是能看到比载体质粒高一些的
10楼2013-07-13 20:03:06
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