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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 人类基因组DNA引物设计问题
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mnbgtrew

铜虫 (初入文坛)

[求助] 人类基因组DNA引物设计问题

虫友们，我小白一枚，想做扩增产物1000bp以上的PCR，手上只有正常人的血液经抽提后的DNA。想问问怎么设计引物？都说用primer5软件来设计，但是我不知道 DNA file啊！
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1楼 2013-06-25 08:54:47
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助 2013-06-27 19:12:35
你是否知道你这所谓的“1000bp以上的序列”的详细信息，是否是一个基因，还是随便一段1000bp以上的序列，说的太笼统了。
你需要的序列，该有序列的相关信息吧，根据相关信息，你所知到的，到数据库去搜索就行了~
建议你补充一下基础知识。
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总有一天我要修改用户名。
3楼2013-06-25 11:13:12
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助, 你还是没有回答我的问题，我只是想要扩增出1000bp以上的序列，我就是想知道我怎样才能找到一段我需要的序列 2013-06-25 10:18:26
第一、你要扩的1000bp以上产物是否是一个基因，你可以在ncbi等数据库查找到该序列
第二、查找到相关序列之后，可以使用相关的引物设计软件来设计。
试验顺利，希望可以帮到你~~
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总有一天我要修改用户名。
2楼2013-06-25 09:00:52
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ILKOBE

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助 2013-06-27 19:12:16
确定的序列的话复制进pp5 直接就可以设计引物了啊 相关的引物设计原则百度上有很多的 可以搜一搜，另外缺失需要补充一下基础知识了。
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4楼2013-06-25 16:18:00
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mnbgtrew

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ILKOBE at 2013-06-25 16:18:00
确定的序列的话复制进pp5 直接就可以设计引物了啊 相关的引物设计原则百度上有很多的 可以搜一搜，另外缺失需要补充一下基础知识了。

前面说了我对此没什么研究，才接触这一块。我知道的是在NCBI可以找到某基因的序列，然后以此为模板设计引物，但是我想知道的是人体有这么多基因，一般用哪一段作为模板比较多。简单点说，我在NCBI里面的search填什么？
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学习交流
5楼2013-06-27 19:11:24
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