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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 人类基因组DNA引物设计问题
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mnbgtrew

铜虫 (初入文坛)

[求助] 人类基因组DNA引物设计问题

虫友们，我小白一枚，想做扩增产物1000bp以上的PCR，手上只有正常人的血液经抽提后的DNA。想问问怎么设计引物？都说用primer5软件来设计，但是我不知道 DNA file啊！
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1楼 2013-06-25 08:54:47
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助, 你还是没有回答我的问题，我只是想要扩增出1000bp以上的序列，我就是想知道我怎样才能找到一段我需要的序列 2013-06-25 10:18:26
第一、你要扩的1000bp以上产物是否是一个基因，你可以在ncbi等数据库查找到该序列
第二、查找到相关序列之后，可以使用相关的引物设计软件来设计。
试验顺利，希望可以帮到你~~
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总有一天我要修改用户名。
2楼2013-06-25 09:00:52
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137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助 2013-06-27 19:12:35
你是否知道你这所谓的“1000bp以上的序列”的详细信息，是否是一个基因，还是随便一段1000bp以上的序列，说的太笼统了。
你需要的序列，该有序列的相关信息吧，根据相关信息，你所知到的，到数据库去搜索就行了~
建议你补充一下基础知识。
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总有一天我要修改用户名。
3楼2013-06-25 11:13:12
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ILKOBE

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mnbgtrew: 金币+1, ★有帮助 2013-06-27 19:12:16
确定的序列的话复制进pp5 直接就可以设计引物了啊 相关的引物设计原则百度上有很多的 可以搜一搜，另外缺失需要补充一下基础知识了。
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4楼2013-06-25 16:18:00
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mnbgtrew

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ILKOBE at 2013-06-25 16:18:00
确定的序列的话复制进pp5 直接就可以设计引物了啊 相关的引物设计原则百度上有很多的 可以搜一搜，另外缺失需要补充一下基础知识了。

前面说了我对此没什么研究，才接触这一块。我知道的是在NCBI可以找到某基因的序列，然后以此为模板设计引物，但是我想知道的是人体有这么多基因，一般用哪一段作为模板比较多。简单点说，我在NCBI里面的search填什么？
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5楼2013-06-27 19:11:24
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ILKOBE

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by mnbgtrew at 2013-06-27 19:11:24
前面说了我对此没什么研究，才接触这一块。我知道的是在NCBI可以找到某基因的序列，然后以此为模板设计引物，但是我想知道的是人体有这么多基因，一般用哪一段作为模板比较多。简单点说，我在NCBI里面的search填什 ...

这个就要根据你研究的内容进行选择了，你的课题是选择哪一段序列进行扩增你就用哪一段来设计引物就行了。你知道你需要的这个序列属于哪个基因，可以直接选择GENE项，然后搜索你的基因名字，选择人的序列然后设计引物。如果你不清楚你需要的序列信息，你可以把他blast一下，选相似度最高的那段序列进行设计。
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6楼2013-06-28 09:03:04
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mnbgtrew

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ILKOBE at 2013-06-28 09:03:04
这个就要根据你研究的内容进行选择了，你的课题是选择哪一段序列进行扩增你就用哪一段来设计引物就行了。你知道你需要的这个序列属于哪个基因，可以直接选择GENE项，然后搜索你的基因名字，选择人的序列然后设计引 ...

谢谢，说的很清楚
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7楼2013-07-15 10:31:06
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zhumeidong

木虫 (小有名气)
你好，我想问下你，人的血液经抽提后的DNA是怎么弄到的？人的血液怎么弄到的啊？我也想要人血液基因组！
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坚持从一点一滴开始！
8楼2013-12-13 09:24:16
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