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jm0305100303

新虫 (小有名气)

[求助] 已经带his标签目的蛋白基因如何设计引物啊(目的基因已经接在pET-22b的载体上了)

分子生物学的新手,正学习设计引物,向各位大侠求助啊……
利用pET-22b的重组质粒去pcr,希望得到带组氨酸标签的目的蛋白基因,因为组氨酸标签用的是CAC,所以设计出来的引物GC%偏高(66.7%),Tm值79.2(上游引物的tm值才56.7,差20多度……),引物里面就是保护碱基(3bp)+酶切位点(6bp)+终止密码子(3bp)+5个GTG(15bp)的重复,一共27个bp,不知道这样的引物能不能p出目的基因来啊,如果能p出来,退火温度应该用多少呢?

[ Last edited by jm0305100303 on 2011-9-19 at 13:09 ]
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+1): 欢迎交流 2011-09-20 17:52:04
jm0305100303(金币+2): 谢谢啊 2011-09-20 20:53:49
jm0305100303(金币+3): 楼下的不能给 就都给你吧 2011-09-20 20:58:14
wanhscn(金币+1): 对的,可以先试试。有的时候不能全部相信软件! 2011-09-21 08:34:23
试试吧,不行的话,再将下游引物延长20 bp ,GC含量就降下来了。
Thank-you,so-blue.
2楼2011-09-20 11:30:06
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 2011-09-21 07:53:54
现在的酶都很好了,PCR是越来越容易了。我们经常做的PCR,一条引物50bp,一条20bp,Primer Premier评分不超过5分,一样能做出来。你这不是很大的问题,按普通PCR的程序去做就是了,退火温度先用常规的55℃,不行的话再试下50℃。
3楼2011-09-20 17:55:13
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jm0305100303

新虫 (小有名气)

西瓜: 木有问题,肯定成功! 2011-09-21 17:09:12
我又往后延伸了20多个bp,但是后面还是gc%很高,温度最后讲到71.多,就这样了,好像用质粒pcr比较容易,引物拿去合成了,希望能p出来,也能酶切的出来,额这个新手第一次搞这个实在是不大给力啊……希望能成功
4楼2011-09-20 20:50:12
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jm0305100303

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-09-20 17:55:13:
现在的酶都很好了,PCR是越来越容易了。我们经常做的PCR,一条引物50bp,一条20bp,Primer Premier评分不超过5分,一样能做出来。你这不是很大的问题,按普通PCR的程序去做就是了,退火温度先用常规的55℃,不行的 ...

想给你金币 说是不是回复求助帖 不能给……
5楼2011-09-20 20:55:36
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jm0305100303 at 2011-09-20 20:55:36:
想给你金币 说是不是回复求助帖 不能给……

没有技术含量的回答,就没想要你金币,所以选的就是“不应助”,哈哈~
6楼2011-09-20 21:04:55
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zc10052157

新虫 (正式写手)

★
西瓜(金币+1): 欢迎交流!互相学习! 2011-09-21 17:09:58
60°一般是黄金温度哦
hold住
7楼2011-09-21 10:10:41
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629837231

新虫 (初入文坛)

你设引物的时候去掉终止密码子啊,

发自小木虫IOS客户端
8楼2017-03-28 01:10:08
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sherry910

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

9楼2017-09-01 09:01:04
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