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aloon111

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何扩增16S-23S间区基因序列？引物如何设计？

如何扩增16S-23S间区基因序列？引物如何设计？为链霉菌。具体点，或推荐个文献。谢谢了。
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1楼 2011-04-09 11:17:38
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kkunny

铜虫 (著名写手)
直接用ITS标准引物不行吗？
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2楼2011-04-10 11:24:19
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aloon111

金虫 (正式写手)
★
wolfebst(金币+1): 谢谢您的参与 2011-04-11 12:31:24
引用回帖:
Originally posted by kkunny at 2011-04-10 11:24:19:
直接用ITS标准引物不行吗？

不是要根据16S和23S的序列来设计引物嘛？
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3楼2011-04-10 19:28:09
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mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)
好像文献上是有现成的引物用的，那个不行吗？
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4楼2011-04-11 11:21:36
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kkunny

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by mirror3895 at 2011-04-11 11:21:36:
好像文献上是有现成的引物用的，那个不行吗？

嗯，我就是直接用文献上的通用引物做的，没有自己设计。
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5楼2011-04-12 09:20:03
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西门炊饼

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我用的是16S/2和23S/7，就是扩增S2-S7之间的序列，结果会出现1-3条带，拿PCR产物去测序，杂合率很高，我是为了鉴定细菌，这么高的杂合率肯定不行，正愁着呢。
查了文献，好像这段区域可变性很高，有转座子，所以会扩出几个条带。
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6楼2011-11-23 15:30:42
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