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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shiliyusly

新虫 (小有名气)

[求助] QPCR之 扩增效率

大家好,做实时定量PCR以前都是用Thermo的试剂盒最近改用promega的,同个基因相同的退火温度,溶解曲线却不同,如下图,promega的溶解曲线圈出部分荧光强度为负值,这样正常吗?应该如何改进呢??谢谢

promega.jpg



thermo.jpg
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shiliyusly

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-04-05 23:50:00
做标准曲线时CT值最好在20-30之间。做标准曲线之前最好做一个退火温度梯度。一般情况下引物在一个温度较广的范围都能有不错的扩增,你需要在不影响扩增的前提下尽量选取高的退火温度。溶解曲线一般是在选定的退火温 ...

嗯,我那个溶解曲线的温度程序是仪器给出的,看他的图好像和你说的差不多哦。
9楼2013-04-06 10:01:11
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shiliyusly: 金币+3, 有帮助 2013-04-04 22:00:03
溶解曲线主要是看有没有非特异的峰,用来判断引物扩增的特异性的,开始几个温度内荧光呈现负值属正常现象,这可能是仪器本身的原因,你的溶解曲线很好,不用做改进了。

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2楼2013-04-04 21:16:36
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shiliyusly

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-04-04 21:16:36
溶解曲线主要是看有没有非特异的峰,用来判断引物扩增的特异性的,开始几个温度内荧光呈现负值属正常现象,这可能是仪器本身的原因,你的溶解曲线很好,不用做改进了。

谢谢你!但是我用的是同一台仪器,只是试剂盒不一样,其他的模板基因等条件都是一样的,溶解曲线却是差别这么大,上面的第一副图圈出那么大部分都是复制,第个溶解曲线只有刚开始的部分是负值,扩增效率也不是很高,90%不到呢
3楼2013-04-04 21:59:54
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gyesang

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【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by shiliyusly at 2013-04-04 21:59:54
谢谢你!但是我用的是同一台仪器,只是试剂盒不一样,其他的模板基因等条件都是一样的,溶解曲线却是差别这么大,上面的第一副图圈出那么大部分都是复制,第个溶解曲线只有刚开始的部分是负值,扩增效率也不是很高 ...

主要看峰是否在同一位置即可,溶解曲线看不出扩增效率,扩增效率要做标准曲线
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-04-04 23:14:01
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