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shiliyusly新虫 (小有名气)
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QPCR之 扩增效率
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大家好,做实时定量PCR以前都是用Thermo的试剂盒最近改用promega的,同个基因相同的退火温度,溶解曲线却不同,如下图,promega的溶解曲线圈出部分荧光强度为负值,这样正常吗?应该如何改进呢??谢谢 promega.jpg thermo.jpg |
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shiliyusly
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3楼2013-04-04 21:59:54
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| 溶解曲线主要是看有没有非特异的峰,用来判断引物扩增的特异性的,开始几个温度内荧光呈现负值属正常现象,这可能是仪器本身的原因,你的溶解曲线很好,不用做改进了。 |
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2楼2013-04-04 21:16:36
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4楼2013-04-04 23:14:01
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| 不知道你的引物的退火温度是多少。在温度较低的情况下,可能是引物与模板发生了anealing,造成双链DNA增加,所以荧光增加,对于熔接曲线来说会产生一点负值区域也属于正常的。一般这种情况下,可以把做熔接曲线的起始温度稍微提高一些,一般是Tm+5°C开始就可以了。不同的盒子这方面不太一样也是可能的。熔接曲线主要看产物是否单一,我觉得你的这个熔接曲线还是不错的。至于扩增效率问题,需要做标准曲线。不到90%是有些低,你是否优化了退火温度? |
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5楼2013-04-05 00:07:07













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