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PCR扩不出目的基因
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PCR扩不出目的基因
从细胞中抽提RNA,然后反转录为cDNA,在做定量PCR前先做普通PCR,可是扩了好几次都没扩出来,跟文献用的是同样的引物,PCR反应条件也是参考文献中的,使用了genomic DNA 作为内参,但最终是只有引物二聚体,扩不出目的条带。不知RNA及后续cDNA质量会不会影响PCR,本人是新手,求指教!
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1楼
2011-09-18 17:08:55
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2楼
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Originally posted by
依依米米
at 2011-09-18 17:24:40:
做不出来有很多原因的,但鉴于你是新手,我个人觉得是不是有些东西加多了,比如酶一般25u的体系加0.5就很多了,但如果你把枪头完全插进去,壁上沾的就不仅仅0.5了,慢慢来,多试几遍,一定要小心谨慎。生物114 [u ...
谢谢解答。酶加多了也会扩不出来吗?
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3楼
2011-09-18 17:26:57
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4楼
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Originally posted by
hgq115
at 2011-09-19 09:51:51:
你参照的文献是什么杂志的,还是建议自己设计一次引物,因为很多中文文献上的引物,直接用来做都很难做出来,我曾经就出过这样的问题。
参考文献的杂志是the journal of biological chemistry.要扩增的基因序列我也查到了,证实引物序列没错。应该还是我的PCR体系有问题,还是一步一步优化条件吧,真难啊
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7楼
2011-09-19 12:39:07
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5楼
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清风寨
at 2011-09-19 11:09:38:
建议自己设计引物 不要所有都参照文献 退火温度可以设置梯度试一下 延伸时间要充足 等等 有时候自己做PCR时同样条件就有时能出来有时出不来 很是郁闷
(⊙v⊙)嗯 下一步就准备这样做,谢谢您的建议
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8楼
2011-09-19 12:39:55
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anhong1122
at 2011-09-19 11:26:21:
是不是引物或者PCR条件的问题,可以优化一下PCR条件啊
引物应该没问题,PCR条件出问题的可能性大,这个PCR还真是麻烦啊
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9楼
2011-09-19 12:40:43
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10楼
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Originally posted by
zhangjing202
at 2011-10-11 10:51:28:
有时候dNTP加多了也P不出来的,建议检查一下体系是否合适
恩恩,现在已经做出来了,就是存在非特异,PCR这东西需要捣鼓的方面太多了,呵呵
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11楼
2011-10-11 11:06:05
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