24小时热门版块排行榜    

查看: 2564  |  回复: 18

wkl1984

金虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR问题求助

做反转录,按照生工的AMV一步反转录试剂盒的具体内容操作,但是试剂盒不建议用随机六聚体引物扩增,我正好用随机六聚体引物扩增了,扩增的结果如下,1为1000kb的marker,2 为RT-PCR产物,marker好像有问题。扩增条件为  预变性45° 30min,PCR扩增94° 15s ,60° 30s,72° 1min,40个循环,终延伸为72°1min。另外,模板DNA的量加了3微升,总模板DNA小余1微克。其余按照试剂盒操作。特异性差一点,请大家给出建议
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

新人小玥

木虫 (正式写手)

请问楼主的具体问题是什么?
您的表述不太明确呀
2楼2011-05-01 09:04:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wkl1984

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-01 09:04:15:
请问楼主的具体问题是什么?
您的表述不太明确呀

就是如何提高特异性,主要是扩增的条带不亮,如何让提高特异性?
3楼2011-05-01 09:09:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

新人小玥

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

wkl1984(金币+2): 2011-05-01 10:47:00
特异性提高呀
1、提高退火温度。不过我觉得你的退火温度已经挺高的了,可以试试两步法。
2、换其它酶试试。
3、再不行就需要重新设计引物了。
4楼2011-05-01 09:44:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wkl1984

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-01 09:44:33:
特异性提高呀
1、提高退火温度。不过我觉得你的退火温度已经挺高的了,可以试试两步法。
2、换其它酶试试。
3、再不行就需要重新设计引物了。

不过我看试剂盒的说明上说可能的原因是反应条件不合适或者是使用的引物问题,我现在不知道主要问题出在那里了,希望给予指点
5楼2011-05-01 10:46:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

新人小玥

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流,很热心。 2011-05-02 00:24:10
wkl1984(金币+2): 2011-05-02 11:20:04
引用回帖:
Originally posted by wkl1984 at 2011-05-01 10:46:42:
不过我看试剂盒的说明上说可能的原因是反应条件不合适或者是使用的引物问题,我现在不知道主要问题出在那里了,希望给予指点

反应条件就是指PCR过程中的PCR体系和PCR反应程序。
引物就是设计引物时是否符合引物特异性标准和是否有可能引入引物二聚体。这就需要你查看一下引物序列。
6楼2011-05-01 20:35:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wkl1984

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-01 20:35:01:
反应条件就是指PCR过程中的PCR体系和PCR反应程序。
引物就是设计引物时是否符合引物特异性标准和是否有可能引入引物二聚体。这就需要你查看一下引物序列。

不过我调了镁离子的浓度可以扩增出条带
7楼2011-05-02 16:31:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

新人小玥

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): 鼓励应助 2011-05-03 00:34:13
wkl1984(金币+3): 2011-05-04 09:51:03
引用回帖:
Originally posted by wkl1984 at 2011-05-02 16:31:56:
不过我调了镁离子的浓度可以扩增出条带

你原来不就可以扩增出条带吗?
你可以把你详细的实验过程告诉我,我帮你分析分析。
例如引物序列,预测获得PCR产物序列、反应体系,程序等等
8楼2011-05-02 20:59:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangqq8282

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): 鼓励新朋友交流 2011-05-03 10:41:51
wkl1984(金币+1): 2011-05-03 13:23:30
wkl1984(金币+12): 2011-05-04 09:51:11
最关键的是引物的设计问题
其次可以提高退火温度,或使用梯度降温
第三要提高核酸电泳技术
9楼2011-05-03 10:28:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wkl1984

金虫 (小有名气)

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-05-06 08:45:06
引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-02 20:59:06:
你原来不就可以扩增出条带吗?
你可以把你详细的实验过程告诉我,我帮你分析分析。
例如引物序列,预测获得PCR产物序列、反应体系,程序等等

扩增条件为  预变性45° 30min,PCR扩增94° 15s ,60° 30s,72° 1min,40个循环,终延伸为72°1min。反应体系为ddH2o 19微升,2×RT-PCR Buffer 25微升,AMV Rt/taq Mix 1微升,随机六聚体引物 2微升,模板DNA 3微升,总体积 50微升。引物为随机六聚体引物,购买于Takara,配置浓度为0.2微摩尔每升。预测得到的PCR的序列长度为400-500bp,具体的序列我没有找到,只是按照构建svFv的操作手册和参考文献进行,可是为什么文献上都不给出CDNA的结果?仅给出了通过cDNA扩增出VH和VL的片段,其中VH和VL的片段大约为350bp,VH的片段为397bp,VL的片段为330bp.并且资料提供说按照cDNA合成试剂盒操作。
10楼2011-05-04 10:06:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wkl1984 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +4 瞬息宇宙 2026-09-01 8/400 2026-09-02 10:35 by 瞬息宇宙
[基金申请] 我不理解! +16 Edward_pc 2026-08-26 24/1200 2026-09-02 10:32 by newfuzzy1
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +17 晴天加油 2026-08-26 19/950 2026-09-02 10:07 by 奶奶的心意
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见