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wkl1984

金虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR问题求助

做反转录,按照生工的AMV一步反转录试剂盒的具体内容操作,但是试剂盒不建议用随机六聚体引物扩增,我正好用随机六聚体引物扩增了,扩增的结果如下,1为1000kb的marker,2 为RT-PCR产物,marker好像有问题。扩增条件为  预变性45° 30min,PCR扩增94° 15s ,60° 30s,72° 1min,40个循环,终延伸为72°1min。另外,模板DNA的量加了3微升,总模板DNA小余1微克。其余按照试剂盒操作。特异性差一点,请大家给出建议
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wkl1984

金虫 (小有名气)

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-05-06 08:45:06
引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-02 20:59:06:
你原来不就可以扩增出条带吗?
你可以把你详细的实验过程告诉我,我帮你分析分析。
例如引物序列,预测获得PCR产物序列、反应体系,程序等等

扩增条件为  预变性45° 30min,PCR扩增94° 15s ,60° 30s,72° 1min,40个循环,终延伸为72°1min。反应体系为ddH2o 19微升,2×RT-PCR Buffer 25微升,AMV Rt/taq Mix 1微升,随机六聚体引物 2微升,模板DNA 3微升,总体积 50微升。引物为随机六聚体引物,购买于Takara,配置浓度为0.2微摩尔每升。预测得到的PCR的序列长度为400-500bp,具体的序列我没有找到,只是按照构建svFv的操作手册和参考文献进行,可是为什么文献上都不给出CDNA的结果?仅给出了通过cDNA扩增出VH和VL的片段,其中VH和VL的片段大约为350bp,VH的片段为397bp,VL的片段为330bp.并且资料提供说按照cDNA合成试剂盒操作。
10楼2011-05-04 10:06:25
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新人小玥

木虫 (正式写手)

请问楼主的具体问题是什么?
您的表述不太明确呀
2楼2011-05-01 09:04:15
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wkl1984

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 新人小玥 at 2011-05-01 09:04:15:
请问楼主的具体问题是什么?
您的表述不太明确呀

就是如何提高特异性,主要是扩增的条带不亮,如何让提高特异性?
3楼2011-05-01 09:09:51
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新人小玥

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

wkl1984(金币+2): 2011-05-01 10:47:00
特异性提高呀
1、提高退火温度。不过我觉得你的退火温度已经挺高的了,可以试试两步法。
2、换其它酶试试。
3、再不行就需要重新设计引物了。
4楼2011-05-01 09:44:33
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