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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】PCR问题求助
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star1987

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】PCR问题求助

请教高手一个问题，我做PCR的时候用上海生工DNA Taq polymerase（红盖子的）（退火温度梯度从45度到65度）都能P出来，而且条带很亮，但是用LA Taq polymerase、Ex Taq polymerase和Prime Star都P不出来。这是什么原因？
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1楼 2010-12-21 15:28:59
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sxxuan

金虫 (著名写手)
★
star1987(金币+1):谢谢 2010-12-21 16:21:28
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2010-12-21 19:07:20
不同的酶，条件有所不同吧。这种情况我也碰到过，当时是提高了退火温度
普通taq，好像比较容易P出来，高保真的没那么简单。当时师兄这样解释给我听
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3楼2010-12-21 16:11:55
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star1987

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by sxxuan at 2010-12-21 16:11:55:
不同的酶，条件有所不同吧。这种情况我也碰到过，当时是提高了退火温度
普通taq，好像比较容易P出来，高保真的没那么简单。当时师兄这样解释给我听

不同的酶条件是不一样，但我用高保真的酶也做了温度梯度，还是P不出来。
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4楼2010-12-21 16:21:09
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天使托

专家顾问 (职业作家)
其实有时就是这样的情况，所以建议一直用一个公司的一种酶！
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5楼2010-12-21 16:23:26
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yabxxh

木虫 (正式写手)
★
star1987(金币+1): 2010-12-21 16:50:00
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2010-12-21 19:07:37
高保真的酶有着其特殊性，保真性能高了，PCR效率就会低，同样的条件肯定不行。
我拿Prime Star来说吧，这个我用的多些。
普通的Taq，退火时间一般为30s，但是这个酶就比较特殊，退火时间10s，我扩增3k的片段照样退火10s，这时候如果你用普通程序肯定做不出来。
建议好好研究一下各个酶的说明书，你会有很大收获的，呵呵，好运
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6楼2010-12-21 16:28:56
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