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wyysunshine

木虫 (知名作家)

[求助] 降落PCR求助! 已有3人参与

如题,PCR程序现为
94℃ 3 min
94℃ 1 min,58℃ 1 min,72℃ 1 min 30 s,3个循环;
94℃ 1 min,55℃ 1 min,72℃ 1 min 30 s,3个循环;
94℃ 1 min,52℃ 1 min,72℃ 1 min 30 s,25个循环;
72℃ 20 min。
跑出来在900 bp左右有一条较亮的带,但有较多杂带,想把这条最亮的跑出来看看是什么,请教该肿么调节程序呢?
之前没跑过降落PCR

降落PCR求助!
未命名.jpg
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顺其自然~~
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biology-boy

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wyysunshine: 金币+5, 有帮助, 谢谢,正在调温度中。。。 2014-03-25 13:47:14
本帖内容被屏蔽

2楼2014-03-25 12:00:44
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wyysunshine: 金币+5, 有帮助, 正有这个打算呢·· 2014-03-25 14:22:26
直接切胶回收测下序可以吗,楼主?
jiayoubashaonian
3楼2014-03-25 14:05:31
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wyysunshine

木虫 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrose8089 at 2014-03-25 14:05:31
直接切胶回收测下序可以吗,楼主?

原本这个引物跑出来应该是1.5kb左右的,但我从一开始跑就是900的样子,不晓得这是咋回事,但我准备把那条很亮的切了测序看看是神马,如果合适的话再重新根据测序结果设计引物,专门跑这条。。。
顺其自然~~
4楼2014-03-25 14:25:34
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wyysunshine: 金币+10, ★★★很有帮助, 表示有点不懂···正在调试中 2014-03-26 15:51:31
你这个touchdown太温柔了,达不到touchdown的分辨效果。
从75oC开始,一个cycle降1oC,降到你需要的最理想的温度,再P你需要的cycles。
另外,touch这个东西,只能叫锦上添花,你要是能看见主带,还有杂带,可以用这个优化,
你要是主带都没看见,只有杂带,估计用了它也无济于事
问题是你的产物大小,是准确计算的么?
例如有没有isoform的问题,etc
5楼2014-03-25 16:21:53
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