24小时热门版块排行榜    

查看: 2377  |  回复: 12

clearth

木虫之王 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】大家看看这对引物(高G+C含量)的退火温度设多少合适

真菌通用引物:(做DGGE分析的,因此GCfung含GC夹)
NS1: 5′-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3′
GCfung: 5′-CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCCATTCCCCGTTACCCGTTG-3′

上海生工合成的引物,报告单显示:

NS1的Tm=53.25℃,GC=42.11%
GCfung的Tm=89.02℃,GC=86.21%
GCfung不带“GC夹”的Tm=57.3℃,GC=55.56%

麻烦大家看看这对引物(高G+C含量)的退火温度设多少合适?谢谢啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scelab

荣誉版主 (文坛精英)



clearth(金币+1):谢谢参与
GC好多啊
不懂,帮顶
2楼2010-12-11 23:23:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigboy123

铜虫 (小有名气)



clearth(金币+1):谢谢参与
兄弟你玩的太高难了!不过建议你一开始先当那个发夹不存在,做做试试,应该没什么问题。哪个GCfung可以多加点,只要出点带,后面就好办。
3楼2010-12-12 10:04:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

clearth

木虫之王 (正式写手)


大家都来帮帮忙啊
4楼2010-12-12 10:05:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

clearth

木虫之王 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by bigboy123 at 2010-12-12 10:04:41:
兄弟你玩的太高难了!不过建议你一开始先当那个发夹不存在,做做试试,应该没什么问题。哪个GCfung可以多加点,只要出点带,后面就好办。

高难?DGGE分析中引物必须带GC夹的
5楼2010-12-12 10:07:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yqhc

金虫 (小有名气)



clearth(金币+1):谢谢参与
68度退火,延伸试一试
6楼2010-12-12 10:33:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainwander

铁杆木虫 (知名作家)



clearth(金币+1):谢谢参与
clearth(金币+1): 2010-12-12 19:59:54
不算GC夹,Tm-5左右
7楼2010-12-12 13:56:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

clearth

木虫之王 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by rainwander at 2010-12-12 13:56:12:
不算GC夹,Tm-5左右

两个引物的Tm相加除以2再减去5度,就是吗?
8楼2010-12-12 20:00:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainwander

铁杆木虫 (知名作家)


引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 20:00:48:

两个引物的Tm相加除以2再减去5度,就是吗?

恩,不把GC夹算在内
9楼2010-12-12 20:03:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ymjxl123

木虫 (著名写手)


大家好,小妹即将生宝宝 ,祈求祝福 谢谢


clearth(金币+1):谢谢参与
太简单啦 兄弟  梯度 pcr  或者降落式pcr
10楼2010-12-12 20:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

clearth

木虫之王 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by ymjxl123 at 2010-12-12 20:25:56:
太简单啦 兄弟  梯度 pcr  或者降落式pcr

你能帮忙设计一个程序吗,谢谢啊,重金感谢
11楼2010-12-12 21:52:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ymjxl123

木虫 (著名写手)


clearth(金币+10): 2010-12-27 09:10:58
引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 21:52:34:

你能帮忙设计一个程序吗,谢谢啊,重金感谢

1 梯度pcr要有机器才行,对于降落式pcr网上条件很多,
:从85℃—>54℃(每4cycles降退火温度5℃),再在54℃退火温度下做18个循环
12楼2010-12-14 17:52:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ymjxl123

木虫 (著名写手)


大家好,小妹即将生宝宝 ,祈求祝福 谢谢

引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 21:52:34:

你能帮忙设计一个程序吗,谢谢啊,重金感谢

1 梯度pcr要有机器才行,对于降落式pcr网上条件很多,
:从85℃—>54℃(每4cycles降退火温度5℃),再在54℃退火温度下做18个循环
13楼2010-12-14 17:52:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 clearth 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 336求调剂 +3 rmc8866 2026-03-21 3/150 2026-03-21 11:16 by 求调剂zz
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 297求调剂 +9 戏精丹丹丹 2026-03-17 9/450 2026-03-21 01:49 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 280求调剂 +7 咕噜晓晓 2026-03-18 8/400 2026-03-21 01:27 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300(化学)304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +4 葵梓卫队 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:02 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
信息提示
请填处理意见