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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】大家看看这对引物（高G+C含量）的退火温度设多少合适
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clearth

木虫之王 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】大家看看这对引物（高G+C含量）的退火温度设多少合适

真菌通用引物：（做DGGE分析的，因此GCfung含GC夹）
NS1: 5′-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3′
GCfung: 5′-CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCCATTCCCCGTTACCCGTTG-3′

上海生工合成的引物，报告单显示：

NS1的Tm=53.25℃，GC=42.11%
GCfung的Tm=89.02℃，GC=86.21%
GCfung不带“GC夹”的Tm=57.3℃，GC=55.56%

麻烦大家看看这对引物（高G+C含量）的退火温度设多少合适？谢谢啊
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1楼 2010-12-11 20:01:00
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ymjxl123

木虫 (著名写手)

大家好，小妹即将生宝宝 ，祈求祝福 谢谢

★
clearth(金币+1):谢谢参与
太简单啦 兄弟  梯度 pcr  或者降落式pcr
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10楼2010-12-12 20:25:56
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ymjxl123

木虫 (著名写手)
clearth(金币+10): 2010-12-27 09:10:58
引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 21:52:34:

你能帮忙设计一个程序吗，谢谢啊，重金感谢

1 梯度pcr要有机器才行，对于降落式pcr网上条件很多，
：从85℃—>54℃（每4cycles降退火温度5℃），再在54℃退火温度下做18个循环
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12楼2010-12-14 17:52:12
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ymjxl123

木虫 (著名写手)

大家好，小妹即将生宝宝 ，祈求祝福 谢谢

引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 21:52:34:

你能帮忙设计一个程序吗，谢谢啊，重金感谢

1 梯度pcr要有机器才行，对于降落式pcr网上条件很多，
：从85℃—>54℃（每4cycles降退火温度5℃），再在54℃退火温度下做18个循环
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13楼2010-12-14 17:52:52
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