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clearth

木虫之王 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】大家看看这对引物(高G+C含量)的退火温度设多少合适

真菌通用引物:(做DGGE分析的,因此GCfung含GC夹)
NS1: 5′-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3′
GCfung: 5′-CGCCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCCATTCCCCGTTACCCGTTG-3′

上海生工合成的引物,报告单显示:

NS1的Tm=53.25℃,GC=42.11%
GCfung的Tm=89.02℃,GC=86.21%
GCfung不带“GC夹”的Tm=57.3℃,GC=55.56%

麻烦大家看看这对引物(高G+C含量)的退火温度设多少合适?谢谢啊
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rainwander

铁杆木虫 (知名作家)


引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-12-12 20:00:48:

两个引物的Tm相加除以2再减去5度,就是吗?

恩,不把GC夹算在内
9楼2010-12-12 20:03:58
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)



clearth(金币+1):谢谢参与
GC好多啊
不懂,帮顶
2楼2010-12-11 23:23:42
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bigboy123

铜虫 (小有名气)



clearth(金币+1):谢谢参与
兄弟你玩的太高难了!不过建议你一开始先当那个发夹不存在,做做试试,应该没什么问题。哪个GCfung可以多加点,只要出点带,后面就好办。
3楼2010-12-12 10:04:41
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clearth

木虫之王 (正式写手)


大家都来帮帮忙啊
4楼2010-12-12 10:05:18
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