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star1987

木虫 (著名写手)


[交流] 【求助/交流】PCR问题求助

请教高手一个问题,我做PCR的时候用上海生工DNA Taq polymerase(红盖子的)(退火温度梯度从45度到65度)都能P出来,而且条带很亮,但是用LA Taq polymerase、Ex Taq polymerase和Prime Star都P不出来。这是什么原因?
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adslye

银虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by wangy0908 at 2010-12-22 12:03:59:

我想问过初级的问题,酶切后P与酶切前P有什么区别的呢??是模板接触的程度有关还是什么的呢?另外,就是怎样判断你要P的区域是否有酶切位点?因为如果有酶切位点的话,也P不出来的啊。因为我做的是小麦的基因 ...

这个为啥基因组要酶切,我没有资料给你。我也是被口传口教授的。但可以想象下~~~空间上的关系~~不过,我偶尔偷懒用基因组直接P都能P出来。
另外至于酶切位点,除非你人品灰常差,否则应该没问题。5个识别位点的切点平均4的5次方才出现一个~当然不排除个别序列的特殊情况。

我想问你下,你如何确定你的引物一定能P出条带,既然你的目的条带未知。
24楼2010-12-22 15:46:13
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查看全部 28 个回答

sxxuan

金虫 (著名写手)



star1987(金币+1):谢谢 2010-12-21 16:21:28
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2010-12-21 19:07:20
不同的酶,条件有所不同吧。这种情况我也碰到过,当时是提高了退火温度
普通taq,好像比较容易P出来,高保真的没那么简单。当时师兄这样解释给我听
3楼2010-12-21 16:11:55
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star1987

木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by sxxuan at 2010-12-21 16:11:55:
不同的酶,条件有所不同吧。这种情况我也碰到过,当时是提高了退火温度
普通taq,好像比较容易P出来,高保真的没那么简单。当时师兄这样解释给我听

不同的酶条件是不一样,但我用高保真的酶也做了温度梯度,还是P不出来。
4楼2010-12-21 16:21:09
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其实有时就是这样的情况,所以建议一直用一个公司的一种酶!
5楼2010-12-21 16:23:26
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