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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?
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wwsw38

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列? 已有14人参与

问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?

我用的16SRDNA通用引物,测序公司给我们的序列里会不会包括该通用引物的序列?
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为自己加油
1楼 2010-05-05 12:44:47
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zhangjingfei01

木虫 (正式写手)
有引物序列的。
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2楼2010-05-05 13:01:27
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gaiyf

金虫 (正式写手)
一般不会出现这种况，但是也会出现当你用contig连接的时候会有一个引物连不上的情况，如果是这样，那就需要测序公司重新测
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多看文献，多学知识
3楼2010-05-05 13:05:28
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wwsw38

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wwsw38 at 2010-05-05 12:44:47:
问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?

我用的16SRDNA通用引物,测序公司给我们的序列里会不会包括该通用引物的序列?

那就是说如果我的上游引物是:AgA gTT TgA TCC Tgg CTC Ag的话,那测序公司给我的序列的一条链开始就是:AgA gTT TgA TCC Tgg CTC Ag
?
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为自己加油
4楼2010-05-05 13:15:19
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liyong1981

金虫 (正式写手)
那是肯定有的～
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5楼2010-05-05 13:17:51
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蓝粉笔

铁虫 (初入文坛)
★ ★
scelab(金币+2):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-05-05 15:35:40
你测序送样为PCR产物时，所得到的结果里不会有PCR扩增引物序列的，因为现在测序使用的原理都是SANGER测序法：使用带有荧光的dNTP及ddNTP进行链延长，电泳记录信号，引物上是没有荧光信号的，所以结果上是看不到引物本身的，而且测序结果的开头会有10到20个碱基是不可信的，这是无法避免的损失。
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6楼2010-05-05 14:26:07
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蓝粉笔

铁虫 (初入文坛)
wwsw38(金币+1):十分感谢,难怪我怎么看那些文献怎么开始的序列都不是引物序列呢,呵呵,太感谢了 2010-05-05 16:36:27
你测序送样为PCR产物时，所得到的结果里不会有PCR扩增引物序列的，因为现在测序使用的原理都是SANGER测序法：使用带有荧光的dNTP及ddNTP进行链延长，电泳记录信号，引物上是没有荧光信号的，所以结果上是看不到引物本身的，而且测序结果的开头会有10到20个碱基是不可信的，这是无法避免的损失。
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7楼2010-05-05 14:48:27
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吃小虫的鸡

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
测序公司停全面的都有吧
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8楼2010-05-05 16:43:26
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ntill

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
PCR通常测正反两个反应就可以拼接出全序列了
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天哪，什么时候才能有100个金币啊！
9楼2010-05-06 09:39:43
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wangxueqin

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引物序列是有的，但是不一定是在开始的那一段，也有可能在中间。
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10楼2010-05-06 10:10:01
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