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请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列
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请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列,如何识别Kozaka序列? 1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA 2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG |
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yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了,你本来金币就很多了,我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊,我是刚来的,还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了,你本来金币就很多了,我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊,我是刚来的,还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04
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KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。 所谓Kozak规则,即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个ATG中的碱基A,T,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下: (1)第4位的偏好碱基为G; (2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T; (3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基; (4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基。 Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可。 From XY经查,你序列里应没有 |
2楼2012-01-03 20:55:47
3楼2012-01-03 22:11:07
4楼2012-01-04 07:22:40
5楼2012-01-04 18:58:27
6楼2012-01-04 21:25:30
7楼2012-01-05 14:22:02










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