24小时热门版块排行榜    

查看: 2615  |  回复: 6

yicao917

木虫 (小有名气)


[交流] 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列

请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列,如何识别Kozaka序列?
1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA

2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cdl007

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了,你本来金币就很多了,我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊,我是刚来的,还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。


所谓Kozak规则,即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个ATG中的碱基A,T,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下:

(1)第4位的偏好碱基为G;
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基;
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基。

Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可。

FromXY



经查,你序列里应没有
2楼2012-01-03 20:55:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by cdl007 at 2012-01-03 20:55:47:
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译 ...

好的,谢谢,不过第二个序列是人体内有的可以表达的额
3楼2012-01-03 22:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)


★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 感谢应助哦,简洁明了又易懂 2012-01-04 08:44:49
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG,基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译,但是翻译效率可能差很多
4楼2012-01-04 07:22:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by dnaxxx at 2012-01-04 07:22:40:
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG,基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译,但是翻译效率可能差很多

若同时存在两个翻译起始区会如何?
5楼2012-01-04 18:58:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)


★ ★
wanhscn(金币+2): 感谢多次应助! 2012-01-04 21:47:16
这个我说不准,但是肯定优先翻译最佳环境的。一般来说生物体内不应该出现靠的那么近的两个起始翻译区,要是有的话可能起着重要的调节作用吧
6楼2012-01-04 21:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diaoruiying

木虫 (著名写手)



yicao917(金币+1):谢谢参与
送鲜花一朵
学习了
7楼2012-01-05 14:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yicao917 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕306英一数二 +8 z1z2z3879 2026-03-16 10/500 2026-03-18 00:01 by 星空星月
[考研] 344求调剂 +4 knight344 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:27 by ruiyingmiao
[考研] 化学工程321分求调剂 +11 大米饭! 2026-03-15 14/700 2026-03-17 17:11 by ruiyingmiao
[考研] 293求调剂 +6 世界首富 2026-03-11 6/300 2026-03-17 17:04 by ruiyingmiao
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +3 小李0854 2026-03-16 3/150 2026-03-17 13:40 by 热情沙漠
[考博] 26申博 +4 八旬速览 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[基金申请] 国自科面上基金字体 +6 iwuli 2026-03-12 7/350 2026-03-16 21:18 by sculhf
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 321求调剂(食品/专硕) +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
信息提示
请填处理意见