应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列
71/1返回列表
查看: 2625  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yicao917

木虫 (小有名气)

[交流] 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列

请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列，如何识别Kozaka序列？
1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA

2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

diaoruiying

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-01-03 15:59:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cdl007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了，你本来金币就很多了，我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊，我是刚来的，还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04
KOZAK是一个女科学家，她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响，并总结出在真核生物中，起始密码子两端序列为：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG时，转录和翻译效率最高，特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列，并被应用于表达载体的构建中。


所谓Kozak规则，即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律，若将第一个ATG中的碱基A，T，G分别标为1，2，3位，则Kozak规则可描述如下：

(1)第4位的偏好碱基为G；
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T；
(3)在-3，-6和-9位置，G是偏好碱基；
(4)除-3，-6和-9位，在整个侧翼序列区，C是偏好碱基。

Kozak规则是基于已知数据的统计结果，不见得必须全部满足，一般来说，满足前两项即可。

FromXY



经查，你序列里应没有
赞一下(4人) 回复此楼
2楼2012-01-03 20:55:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by cdl007 at 2012-01-03 20:55:47:
KOZAK是一个女科学家，她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响，并总结出在真核生物中，起始密码子两端序列为：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG时，转录和翻译 ...

好的，谢谢，不过第二个序列是人体内有的可以表达的额
赞一下 回复此楼
3楼2012-01-03 22:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)
★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 感谢应助哦，简洁明了又易懂 2012-01-04 08:44:49
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG，基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译，但是翻译效率可能差很多
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2012-01-04 07:22:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)
引用回帖:
楼: Originally posted by dnaxxx at 2012-01-04 07:22:40:
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG，基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译，但是翻译效率可能差很多

若同时存在两个翻译起始区会如何？
赞一下 回复此楼
5楼2012-01-04 18:58:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)
★ ★
wanhscn(金币+2): 感谢多次应助！ 2012-01-04 21:47:16
这个我说不准，但是肯定优先翻译最佳环境的。一般来说生物体内不应该出现靠的那么近的两个起始翻译区，要是有的话可能起着重要的调节作用吧
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-01-04 21:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diaoruiying

木虫 (著名写手)
★
yicao917(金币+1):谢谢参与
送鲜花一朵
学习了
回复此楼
7楼2012-01-05 14:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yicao917 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 10/500 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 【同济软件】软件（085405）考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 化工学硕306求调剂 +10 42838695 2026-03-12 10/500 2026-03-18 14:42 by haxia
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-13 6/300 2026-03-18 14:14 by 脱颖而出
[考研] 0703化学求调剂 总分331 +3 ZY-05 2026-03-13 3/150 2026-03-18 10:58 by macy2011
[考研] 293求调剂 +11 zjl的号 2026-03-16 16/800 2026-03-18 08:10 by zhukairuo
[考研] 296求调剂 +5 大口吃饭 身体健 2026-03-13 5/250 2026-03-17 21:05 by 不惑可乐
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭