24小时热门版块排行榜    

查看: 2994  |  回复: 6

yicao917

木虫 (小有名气)


[交流] 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列

请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列,如何识别Kozaka序列?
1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA

2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cdl007

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了,你本来金币就很多了,我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊,我是刚来的,还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译效率最高,特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列,并被应用于表达载体的构建中。


所谓Kozak规则,即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律,若将第一个ATG中的碱基A,T,G分别标为1,2,3位,则Kozak规则可描述如下:

(1)第4位的偏好碱基为G;
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T;
(3)在-3,-6和-9位置,G是偏好碱基;
(4)除-3,-6和-9位,在整个侧翼序列区,C是偏好碱基。

Kozak规则是基于已知数据的统计结果,不见得必须全部满足,一般来说,满足前两项即可。

FromXY



经查,你序列里应没有
2楼2012-01-03 20:55:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by cdl007 at 2012-01-03 20:55:47:
KOZAK是一个女科学家,她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响,并总结出在真核生物中,起始密码子两端序列为:——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——,如GCCACCATGG、GCCATGATGG时,转录和翻译 ...

好的,谢谢,不过第二个序列是人体内有的可以表达的额
3楼2012-01-03 22:11:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)


★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 感谢应助哦,简洁明了又易懂 2012-01-04 08:44:49
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG,基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译,但是翻译效率可能差很多
4楼2012-01-04 07:22:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)


引用回帖:
: Originally posted by dnaxxx at 2012-01-04 07:22:40:
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG,基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译,但是翻译效率可能差很多

若同时存在两个翻译起始区会如何?
5楼2012-01-04 18:58:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dnaxxx

至尊木虫 (小有名气)


★ ★
wanhscn(金币+2): 感谢多次应助! 2012-01-04 21:47:16
这个我说不准,但是肯定优先翻译最佳环境的。一般来说生物体内不应该出现靠的那么近的两个起始翻译区,要是有的话可能起着重要的调节作用吧
6楼2012-01-04 21:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diaoruiying

木虫 (著名写手)



yicao917(金币+1):谢谢参与
送鲜花一朵
学习了
7楼2012-01-05 14:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yicao917 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖? +4 CrisMessi 2026-08-18 4/200 2026-08-19 00:53 by gatelove
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 27/1350 2026-08-18 21:44 by Noways
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 5/250 2026-08-18 19:25 by wangzilk
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +51 医学老男孩 2026-08-13 110/5500 2026-08-18 19:07 by icerianxia
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见