[交流] 请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列

请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列，如何识别Kozaka序列？
1、CCGTAAGTTTTACCAACAGACTGCAGTTTCTTCACTACCAAA

2、ACAAGTTTGTACAAAAAAGCTGAACGAGAAACGTAAAATGATATAAATATCAATATATTAAATTAGATTTTGCATAAAAAACAGACTACATAATACTGTAAAACACAACATATCCAGTCACTATG

回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

diaoruiying

» 猜你喜欢

GSPT1口服分子胶降解剂MRT-2359 | Biochempartner 已经有0人回复
碳青霉烯类抗生素为何需联用西司他丁钠？ | Biochempartner 已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有149人回复
源自蕨类植物的抗炎美白活性分子去甲氧基荚果蕨素 | Biochempartner 已经有0人回复
肠道里的"代谢开关"：Fexaramine用肠道限制性重新定义 FXR 激动剂已经有0人回复
DMXAA：从血管破坏剂到STING通路研究的关键工具分子 | Biochempartner 已经有0人回复
靶向PD-L1的人源化单克隆抗体阿特珠单抗已经有0人回复
"探针之父"(+)-JQ-1如何改变表观遗传研究 | Biochempartner 已经有0人回复
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松已经有0人回复
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析已经有0人回复
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长已经有4人回复
pET20b是否含有lac operator序列已经有5人回复
怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽~~ 已经有11人回复
公司返回的双向测通的序列个人如何拼接啊？已经有9人回复
判断一个混杂序列中是否有满足一定长度的子周期序列？已经有4人回复
两个基因序列能不能做荧光定量PCR？请教大家一下！！！已经有4人回复
不同来源的同一种微生物基因序列是否相同已经有12人回复
【求助/交流】两条序列只有1-2个变异位点，能设计特异引物区别出来吗？已经有23人回复
【求助/交流】已知N端11个氨基酸序列如何设计引物已经有6人回复
【求助/交流】举例说明模式生物中一个基因的序列的获取、序列分析和功能分析已经有8人回复
【求助/交流】请教多个蛋白质序列比对显示保守区域的问题已经有9人回复
【求助/交流】问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列? 已经有16人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2012-01-03 15:59:23

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1866.6
帖子: 197
在线: 48.9小时
虫号: 695482

引用回帖:

楼: Originally posted by dnaxxx at 2012-01-04 07:22:40:
kozak序列简单可以简单地描述为ANNATGG，基本上是真核生物起始密码子的最优环境。其它序列不是不可以翻译，但是翻译效率可能差很多

若同时存在两个翻译起始区会如何？

赞一下

回复此楼

5楼2012-01-04 18:58:27

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 7 个回答

cdl007

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
小丹木木(金币+1): 学习了，你本来金币就很多了，我就少给点了 2012-01-04 08:38:52
小丹木木: 是专家顾问啊，我是刚来的，还不是很熟悉各位前辈啊 2012-01-04 08:42:10
小丹木木(金币+1, 专家考核): 补上额 2012-01-05 15:48:04

KOZAK是一个女科学家，她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响，并总结出在真核生物中，起始密码子两端序列为：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG时，转录和翻译效率最高，特别是-3位的A对翻译效率非常重要。该序列被后人称为Kozak序列，并被应用于表达载体的构建中。

所谓Kozak规则，即第一个ATG侧翼序列的碱基分布所满足的统计规律，若将第一个ATG中的碱基A，T，G分别标为1，2，3位，则Kozak规则可描述如下：

(1)第4位的偏好碱基为G；
(2)ATG的5’端约15bp范围的侧翼序列内不含碱基T；
(3)在-3，-6和-9位置，G是偏好碱基；
(4)除-3，-6和-9位，在整个侧翼序列区，C是偏好碱基。

Kozak规则是基于已知数据的统计结果，不见得必须全部满足，一般来说，满足前两项即可。

From

XY

经查，你序列里应没有

赞一下(4人)

回复此楼

2楼2012-01-03 20:55:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

yicao917

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1866.6
帖子: 197
在线: 48.9小时
虫号: 695482

引用回帖:

楼: Originally posted by cdl007 at 2012-01-03 20:55:47:
KOZAK是一个女科学家，她研究过起始密码子ATG周边碱基定点突变后对转录和翻译所造成的影响，并总结出在真核生物中，起始密码子两端序列为：——G/N-C/N-C/N-ANNATGG——，如GCCACCATGG、GCCATGATGG时，转录和翻译 ...

好的，谢谢，不过第二个序列是人体内有的可以表达的额

赞一下

回复此楼

3楼2012-01-03 22:11:07

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖